Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  404  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125143508--125143574
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1.9
35
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8
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23
2
0
73
0.97
125143508--125143575
36
1.9
35
82
14
86
23
2
0
73
0.97
125143478--125143605
60
2.2
57
80
9
143
25
3
1
68
1.15
125147010--125147058
26
2.0
24
84
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62
61
6
0
32
1.21
125147037--125147084
21
2.3
20
82
7
51
70
8
0
20
1.12
125148671--125148956
136
2.1
137
94
0
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32
24
17
24
1.97
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12
2.1
12
100
0
50
32
0
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1.44
125150751--125150886
26
5.2
26
94
0
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2.1
136
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2
518
31
25
18
24
1.97
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2.0
17
100
0
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35
5
17
41
1.74
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26
5.2
26
93
0
227
37
24
5
33
1.78
125156657--125156791
52
2.6
52
97
1
254
37
24
5
33
1.78
125158777--125158874
45
2.2
45
90
3
153
39
18
19
22
1.92
125158852--125158876
12
2.1
12
100
0
50
40
20
24
16
1.91
125159915--125159958
20
2.1
21
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4
54
4
6
13
75
1.17
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2.0
25
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12
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63
4
0
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1.13
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2
15.5
2
93
0
53
54
0
0
45
0.99
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40
6.2
40
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3
313
22
20
29
27
1.99
125166056--125166303
81
3.1
80
87
3
340
22
20
29
27
1.99
125174292--125174540
40
6.2
40
88
2
322
22
21
28
27
1.99
125174292--125174540
81
3.1
80
88
4
351
22
21
28
27
1.99
125174291--125174520
121
1.9
121
88
1
345
22
22
29
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125179764--125179855
3
31.3
3
69
16
50
30
4
3
61
1.31
125179824--125179882
9
7.1
8
76
16
50
35
5
3
55
1.38
125179930--125179982
21
2.4
21
84
15
63
28
9
0
62
1.26
125179914--125179978
33
1.9
33
81
9
78
26
9
1
63
1.34
125181731--125181878
79
1.9
80
88
4
228
25
22
27
25
2.00
125181731--125181911
79
2.3
79
84
5
224
27
22
26
24
2.00
125181731--125181878
40
3.7
40
88
5
228
25
22
27
25
2.00
125185656--125185689
13
2.6
14
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13
54
61
0
23
14
1.33
125185821--125185871
17
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20
73
20
54
41
0
0
58
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25
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25
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21
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38
0
1
60
1.05
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17
2.0
17
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50
0
8
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1.34
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15
2.0
15
93
0
51
66
3
0
30
1.07
125188996--125189147
79
1.9
80
86
6
220
44
13
11
30
1.79
125193629--125193902
6
45.7
6
81
0
143
16
39
2
41
1.62
125193660--125193892
12
19.4
12
78
0
205
17
41
3
38
1.65
125193572--125193922
48
7.2
48
80
1
225
16
39
2
41
1.64
125193629--125193896
12
22.3
12
77
0
194
16
39
2
41
1.63
125193723--125193924
42
4.8
42
76
2
181
16
38
3
40
1.68
125193882--125193945
30
2.1
30
94
0
110
15
31
6
46
1.71
125194007--125194039
17
1.9
17
88
11
50
60
0
21
18
1.36
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2
21.0
2
95
4
77
48
2
0
48
1.14
125194838--125194906
21
3.3
21
64
16
54
36
4
2
56
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125194899--125194952
20
2.8
20
83
5
67
35
5
0
59
1.21
125195011--125195134
19
6.5
19
66
10
58
29
2
1
66
1.14
125195086--125195132
9
5.3
9
82
12
53
25
0
4
70
1.05
125195999--125196114
40
3.0
40
78
12
116
32
4
0
62
1.21
125195994--125196104
20
5.6
19
69
21
68
33
3
0
62
1.19
125196046--125196112
20
3.5
19
75
17
66
35
4
0
59
1.18
125196229--125196299
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8.2
8
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30
0
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67
0.99
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2.9
26
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93
32
0
1
66
1.00
125196234--125196304
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20
67
30
0
1
67
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1.9
25
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4
60
68
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6
17
1.37
125198447--125198481
11
3.1
12
88
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34
0
0
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1.9
22
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0
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1
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5.6
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10
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25
16
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14
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2.8
86
85
6
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16
18
38
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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2
34
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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0
7
60
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2.4
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8
55
53
0
2
43
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433