Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  367  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115191289--115191327
19
2.0
20
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33
0
10
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1.33
115191260--115191371
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1.9
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0
170
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14
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1.69
115194994--115195045
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1.9
27
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1
0
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47
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2
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7.5
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13
246
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23
23
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115198342--115198792
208
2.1
211
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16
23
23
1.95
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3.2
101
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22
24
1.94
115198676--115198806
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2.4
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2.2
25
100
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27
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3
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25
25
22
25
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115212873--115213078
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2.6
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247
25
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2.00
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4.9
19
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2.4
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0
0
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108
43
0
0
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40
0
0
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45
0
0
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1.00
115229071--115229141
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6.5
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58
36
1
2
59
1.21
115229060--115229141
44
1.9
42
85
7
112
35
1
2
60
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115229064--115229238
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3.3
51
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131
38
2
2
56
1.24
115229210--115229252
16
2.8
16
86
13
63
39
0
0
60
0.97
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1.9
106
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11
247
38
1
2
56
1.24
115229242--115229309
22
3.1
21
79
6
64
44
1
1
52
1.19
115229268--115229314
21
2.3
20
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10
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0
0
59
0.97
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4.3
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9
120
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23
21
16
1.93
115235846--115235959
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2.1
53
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158
37
23
21
16
1.93
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14
2.8
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14
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40
1.75
115237587--115237743
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26
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5
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1.79
115237587--115237743
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35
24
5
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22
16
1.94
115241701--115241814
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2.1
54
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160
36
23
22
16
1.94
115243429--115243616
26
7.2
26
95
0
322
36
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1.80
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5.0
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1
359
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23
14
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1.91
115258168--115258236
30
2.3
31
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5
88
30
18
2
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2.0
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0
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3.0
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95
0
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38
25
1.65
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111
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37
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25
2.0
25
84
8
64
36
24
18
20
1.94
115276422--115276533
27
4.1
28
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10
144
15
24
22
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1.92
115276422--115276533
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2.1
54
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163
15
24
22
38
1.92
115278094--115278187
29
3.2
29
96
0
170
27
27
15
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115278057--115278187
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2.3
58
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2
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26
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16
25
1.96
115282445--115282475
11
2.8
11
90
0
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61
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16
12
1.56
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19
2.1
19
100
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30
25
22
22
1.99
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17
3.2
16
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14
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1
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1.20
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2
0
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1.11
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47
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1.73
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17
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0
11
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16
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52
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16
1.47
115323987--115324044
28
2.1
28
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0
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3
36
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3
100
0
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0
0
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0.89
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12
2.3
12
100
0
56
14
0
0
85
0.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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132
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0
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13
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29
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17
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18
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10
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19
1.93
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28
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2.7
98
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331
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2.0
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4
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58
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22
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19
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2
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18
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0
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0
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0
75
0.97
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30
1.9
29
89
10
89
17
7
0
75
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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2.0
118
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0
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2
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130
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2.1
103
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26
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25
2.00
115475610--115475833
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27
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26
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26
1.99
115482685--115482908
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1.99
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2.6
78
79
10
227
25
20
27
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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1
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0
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0
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0
0.75
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19
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1
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17
23
29
1.97
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1.96
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1.95
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1.95
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115522534--115522704
46
3.7
46
77
14
199
28
28
22
21
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433