Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  395  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122710944--122711892
351
2.7
350
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2
1224
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23
21
1.97
122713332--122713495
3
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3
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29
7
2
60
1.38
122713348--122713490
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5.4
28
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12
126
28
8
2
60
1.37
122713417--122713492
25
3.0
25
84
13
93
28
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0
61
1.26
122713349--122713490
13
10.5
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16
104
28
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2
60
1.37
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0
0
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2.0
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100
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0
0
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0
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0
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100
0
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0
0
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2
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18
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122725346--122725602
45
5.8
45
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33
18
16
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27
2.5
27
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0
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22
25
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0
0
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62
0
0
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0.95
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54
2
0
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1.13
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26
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9
26
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46
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21
23
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122742756--122742823
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2.3
30
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29
17
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47
1.71
122746818--122746851
16
2.0
18
88
11
54
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0
0
35
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122748415--122748461
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3.0
16
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3
60
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4
0
48
1.21
122748878--122749241
180
2.0
183
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2
590
24
11
22
41
1.87
122750611--122750680
34
2.1
34
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0
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51
2
7
38
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122751854--122751896
23
1.9
23
90
4
70
13
0
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26
2.9
26
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3
120
46
0
14
39
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122752258--122752410
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2.7
56
96
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3
37
1.44
122752261--122752403
27
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82
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37
1.46
122752637--122752681
24
2.0
23
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17
22
33
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1.96
122752920--122752988
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2.3
30
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14
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100
0
50
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16
0
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7
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93
0
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57
10
0
32
1.32
122753478--122753522
14
3.2
14
87
12
58
57
13
0
28
1.36
122754481--122754577
48
2.0
48
88
2
142
56
3
7
32
1.42
122757446--122757489
16
2.8
16
86
6
54
70
2
11
15
1.26
122767427--122767461
6
6.0
6
90
3
54
65
2
31
0
1.07
122770082--122770111
15
1.9
16
93
6
53
33
3
16
46
1.64
122770710--122770756
20
2.3
21
78
10
53
42
0
10
46
1.38
122770989--122771037
18
2.7
18
81
6
55
30
24
12
32
1.92
122772005--122772038
16
2.2
15
89
5
50
52
11
5
29
1.61
122772589--122772727
56
2.5
56
92
2
228
37
1
5
55
1.33
122772589--122772745
56
2.8
56
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176
37
1
5
54
1.35
122774274--122774312
19
2.1
19
90
0
60
56
0
5
38
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122774673--122774931
143
1.8
142
79
5
299
49
4
4
41
1.41
122778921--122779340
226
1.9
216
88
4
624
49
17
17
15
1.81
122783835--122783891
22
2.6
22
72
2
62
24
10
3
61
1.44
122785384--122785417
17
2.0
17
88
0
50
29
8
0
61
1.26
122787565--122787605
2
21.5
2
90
9
68
46
0
0
53
1.00
122788297--122788335
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19.5
2
100
0
78
51
0
0
48
1.00
122788713--122788817
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10
99
22
19
26
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1.98
122791083--122791264
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2.8
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75
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178
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16
31
23
1.96
122794112--122794150
18
2.2
18
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0
51
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24
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79
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23
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2.0
21
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0
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6
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1.51
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2.2
29
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5
74
26
7
9
55
1.59
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17
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1.17
122811712--122811768
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73
17
3
5
1.16
122812331--122812369
2
19.5
2
89
0
60
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2
48
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25
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72
3.1
72
83
3
252
25
17
22
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1.96
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315
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15
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35
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2.0
88
85
5
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20
20
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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2
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0
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74
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75
89
2
225
30
18
23
27
1.98
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74
1.9
75
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2
205
30
19
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26
1.98
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19
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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0
1
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1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0
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1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433