Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  25  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6550544--6550572
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0
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27
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0
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0
0
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2.4
27
81
2
74
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9
1
58
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
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1.38
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24
2.7
27
78
17
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32
8
1
57
1.39
6629838--6629904
27
2.5
27
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18
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2
2
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1.23
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0
10
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51
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182
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5
25
36
1.79
6637677--6637784
25
4.2
26
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4
184
33
5
25
36
1.79
6639266--6639318
26
2.0
26
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72
37
22
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24
1.92
6640603--6640710
26
4.2
26
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1.83
6640602--6640700
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52
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0
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5
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23
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4
52
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0
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14
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0
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62
1.13
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20
2.6
21
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3
72
32
0
5
62
1.19
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2.3
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20
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8
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2.4
28
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11
5
50
1.63
6645674--6645752
27
3.1
25
78
10
81
31
12
5
50
1.62
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2.0
15
100
0
60
26
40
13
20
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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2.0
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18
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1.95
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5.0
174
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1266
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19
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0
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22
14
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51
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2.0
72
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18
20
35
1.95
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1.9
14
100
0
54
22
14
11
51
1.73
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1.9
72
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184
25
18
22
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2.0
20
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21
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0
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0
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1
0
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19
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17
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11
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31
0
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60
1.24
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30
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2
6
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1.39
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7
5
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1.53
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5
1
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3
13.7
3
80
14
50
66
0
2
30
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6681967--6682009
23
2.0
21
86
9
59
65
2
6
25
1.30
6682200--6682248
22
2.2
23
89
10
84
61
4
4
30
1.33
6684239--6684395
74
2.1
73
84
5
199
35
19
14
29
1.92
6684305--6684661
87
4.0
90
82
5
399
39
16
15
29
1.89
6684223--6685028
164
5.0
163
76
13
622
36
18
15
28
1.92
6684479--6685028
162
3.5
163
76
12
400
35
19
16
29
1.93
6684555--6684588
16
2.1
16
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10
52
67
0
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20
1.21
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75
3.7
74
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372
35
20
15
29
1.93
6684605--6684884
148
1.9
148
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399
35
20
15
28
1.93
6684802--6684973
89
1.9
88
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4
283
38
19
15
26
1.91
6684891--6685027
73
1.9
72
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1
202
32
21
15
30
1.94
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44
2.5
44
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13
22
16
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25
2.2
24
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12
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46
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37
1.64
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29
2.7
32
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18
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1
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1.26
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3
13.7
3
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14
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0
2
30
1.04
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23
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21
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65
2
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25
1.30
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24
2.1
24
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3
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2.0
23
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17
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1.22
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2
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100
0
66
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0
0
48
1.00
6715308--6715344
17
2.2
17
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4
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89
2
8
0
0.58
6715311--6715344
12
2.9
11
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8
50
88
2
8
0
0.62
6715340--6715372
13
2.3
15
90
10
52
66
24
0
9
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6715307--6715416
49
2.4
42
74
22
105
77
11
6
4
1.11
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12
3.0
12
95
0
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30
25
2
41
1.69
6723181--6723603
71
6.2
69
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12
403
24
14
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122
2.0
124
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3
392
24
13
22
39
1.90
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263
2.3
257
95
2
1042
25
14
22
36
1.93
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2.3
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244
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15
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1.9
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5
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30
18
22
28
1.97
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2.9
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20
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76
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29
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13
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1.65
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30
2.1
30
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19
9
29
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1.83
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253
2.3
246
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18
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16
2.2
16
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5
54
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2
8
0
0.61
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15
2.3
15
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10
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27
0
6
1.15
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6
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1.20
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79
2.0
79
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10
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0
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0
0
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0.98
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17
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18
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58
16
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1.86
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18
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17
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15
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15
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16
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7
0
13
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10
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69
0
0
30
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30
2.4
31
79
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85
11
27
37
23
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6742422--6742472
23
2.2
23
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0
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2.1
38
100
0
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1.92
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2.2
14
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0
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48
12
0
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2.0
31
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0
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2.1
15
100
0
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19
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1.9
17
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5
50
29
0
0
70
0.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433