Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  343  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107720180--107720286
42
2.5
42
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0
178
29
14
31
23
1.95
107720294--107720363
27
2.5
28
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2
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27
14
25
32
1.94
107733098--107733198
28
3.5
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86
6
114
29
13
26
29
1.94
107736957--107737360
199
2.0
199
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0
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2.2
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9
115
26
17
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1.95
107741067--107741223
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3.7
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23
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1.97
107744807--107745074
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5.6
47
76
8
227
27
20
28
22
1.99
107744807--107745074
94
2.8
94
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5
322
27
20
28
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1.99
107744807--107745076
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195
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20
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2.0
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6
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46
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2.0
216
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16
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2.0
23
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107757910--107758173
92
2.9
92
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2
325
34
20
21
23
1.96
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21
2.3
21
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0
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20
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1
20
1.13
107759348--107759427
15
5.3
14
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24
65
72
6
1
20
1.13
107762853--107762920
5
13.8
5
79
14
54
72
4
0
23
1.03
107762856--107762920
16
4.4
15
74
20
57
70
4
0
24
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107766305--107766380
9
7.4
10
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19
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75
7
14
2
1.14
107766305--107766380
5
14.8
5
73
19
50
75
7
14
2
1.14
107766407--107766436
15
2.0
15
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0
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6
0
16
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25
2.4
25
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0
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27
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16
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2.1
56
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213
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8
35
1.61
107776587--107776617
11
2.8
11
95
0
53
67
6
9
16
1.39
107791344--107791372
14
2.0
15
93
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51
27
17
0
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1.42
107792075--107792117
8
5.5
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52
39
2
0
58
1.11
107792080--107792131
23
2.3
23
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3
1
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1.31
107793891--107793977
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2.3
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5
147
26
33
19
20
1.97
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7.2
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0
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34
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5.8
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1
340
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25
19
28
1.99
107800166--107800252
37
2.3
36
94
5
147
26
33
19
20
1.97
107800323--107800573
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49
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0
448
30
26
8
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1.87
107806767--107806808
15
2.8
15
88
0
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16
16
14
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1.94
107809127--107809373
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38
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1.95
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3.4
85
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0
513
29
14
24
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1.95
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3.4
27
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130
32
13
25
28
1.93
107817009--107817099
37
2.4
37
90
1
146
25
32
17
24
1.97
107817195--107817411
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5
310
29
30
9
30
1.89
107817331--107817405
22
3.3
22
68
23
64
25
32
13
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107817189--107817412
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2.3
97
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321
29
29
9
31
1.88
107823407--107823509
42
2.4
44
83
4
138
26
15
22
35
1.94
107827134--107827165
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2
93
0
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53
0
46
0
1.00
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16
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1
0
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1.12
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19
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1
0
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1.07
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3.0
23
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2
77
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10
15
44
1.79
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30
3.6
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1
15
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1.57
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14
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0
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1.9
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0
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12
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0
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6
21
48
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18
2.3
18
91
4
66
14
24
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19
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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28
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1.78
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1.99
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1.98
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0
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15
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
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7
1
38
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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25
24
27
22
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433