Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  427  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131165690--131165881
95
2.0
95
96
0
357
23
24
14
38
1.92
131165759--131165812
26
2.1
26
100
0
108
22
24
14
38
1.91
131165784--131165929
69
2.1
69
87
0
211
26
23
13
37
1.91
131165803--131165945
69
2.1
69
82
0
169
25
24
13
36
1.92
131171397--131171421
10
2.5
10
100
0
50
76
8
8
8
1.18
131171550--131171585
2
18.0
2
94
0
54
50
5
0
44
1.25
131171708--131171732
11
2.3
11
100
0
50
40
16
12
32
1.84
131175290--131175389
3
32.3
3
70
16
62
32
6
2
60
1.32
131175563--131175629
3
21.7
3
82
11
82
34
0
1
64
1.03
131175868--131175915
22
2.1
22
84
7
60
35
10
2
52
1.48
131175881--131175922
22
1.9
22
85
0
57
33
16
0
50
1.46
131181381--131181490
26
4.2
26
97
0
184
33
5
24
36
1.79
131182918--131182988
26
2.7
26
84
4
79
35
22
11
30
1.89
131183095--131183210
27
4.3
27
91
1
178
18
24
24
33
1.97
131183095--131183232
54
2.6
55
87
4
185
18
23
23
34
1.96
131183093--131183232
27
5.3
26
85
9
133
17
23
23
35
1.96
131187166--131187275
26
4.2
26
97
0
184
33
5
24
36
1.79
131188891--131189006
27
4.3
27
91
1
178
18
24
24
33
1.97
131188891--131189029
54
2.6
55
88
3
194
17
24
23
34
1.96
131197402--131197437
14
2.6
14
95
0
63
22
16
5
55
1.62
131197342--131197644
103
2.9
102
88
5
423
25
16
18
39
1.91
131197506--131197554
14
3.5
13
91
5
71
16
18
8
57
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131197609--131197641
15
2.1
16
94
5
59
18
9
6
66
1.40
131197416--131198149
174
4.1
187
79
14
686
27
17
18
36
1.93
131197523--131198058
174
3.1
176
86
6
709
25
17
19
37
1.93
131197520--131197977
86
5.2
86
88
5
634
25
17
18
38
1.93
131197800--131198183
159
2.3
160
85
7
513
29
17
19
32
1.95
131197904--131198050
73
2.0
73
89
0
222
29
18
20
31
1.96
131198137--131198365
56
4.2
54
91
3
370
27
13
18
40
1.88
131200187--131200289
3
33.3
3
71
16
68
32
5
2
59
1.36
131200463--131200514
3
16.7
3
77
15
52
34
0
1
63
1.06
131200753--131200800
22
2.1
22
84
7
60
35
10
2
52
1.48
131200766--131200807
22
1.9
22
85
0
57
33
16
0
50
1.46
131202287--131202319
2
16.5
2
93
0
57
48
0
3
48
1.17
131202372--131202400
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
131204067--131204119
26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
131205599--131205705
26
4.2
26
91
2
180
36
24
6
32
1.81
131205599--131205705
51
2.1
52
94
1
189
36
24
6
32
1.81
131211097--131211144
24
2.0
25
83
4
62
25
14
20
39
1.91
131212629--131212736
26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
131214363--131214398
17
2.1
17
100
0
72
63
0
0
36
0.94
131214369--131214527
25
6.2
25
65
22
62
55
2
5
35
1.37
131214490--131214566
15
4.9
15
72
19
50
58
6
5
29
1.45
131214766--131214805
15
2.6
16
84
7
57
60
12
0
27
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131214826--131214860
18
1.9
18
88
0
52
62
2
2
31
1.24
131216287--131216421
26
5.2
26
90
1
218
34
5
23
37
1.77
131216287--131216421
51
2.6
51
92
2
225
34
5
23
37
1.77
131218203--131218487
135
2.1
137
96
1
520
24
18
25
31
1.97
131219832--131219867
18
2.0
18
94
0
63
30
16
13
38
1.88
131219957--131220487
132
4.0
131
77
6
491
27
19
18
34
1.95
131222907--131223015
26
4.2
26
92
1
175
33
5
23
36
1.78
131224793--131225076
135
2.1
136
96
2
518
24
17
25
32
1.97
131226315--131226341
12
2.2
12
100
0
54
11
22
51
14
1.73
131228434--131228468
16
2.2
16
90
5
54
88
2
8
0
0.61
131228464--131228500
16
2.3
16
95
0
65
64
29
0
5
1.15
131228459--131228501
17
2.5
17
85
7
61
67
25
2
4
1.22
131228421--131228513
43
2.1
42
84
7
114
73
18
5
3
1.16
131232718--131232827
26
4.2
26
92
0
175
33
5
23
37
1.78
131234575--131234860
136
2.1
137
96
0
520
24
17
24
32
1.97
131237182--131237212
15
2.1
15
100
0
62
41
12
6
38
1.69
131242522--131242571
22
2.2
23
85
3
66
32
0
10
58
1.31
131242796--131243041
69
3.6
69
87
2
350
23
24
12
39
1.89
131242796--131243070
138
2.0
138
84
2
356
24
25
12
37
1.91
131248470--131248510
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
131252232--131252275
20
2.2
19
84
15
54
36
0
0
63
0.95
131256074--131256208
26
5.2
26
92
1
227
36
25
5
33
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131261874--131261983
26
4.2
26
92
0
184
36
24
5
33
1.79
131261874--131261983
52
2.1
52
100
0
220
36
24
5
33
1.79
131262411--131262520
26
4.2
26
94
2
177
34
4
24
36
1.76
131263957--131264031
26
2.8
26
80
8
71
36
21
10
32
1.88
131264135--131264274
27
5.2
27
86
2
174
17
23
22
35
1.95
131264135--131264274
54
2.6
55
88
2
194
17
23
22
35
1.95
131264336--131264375
19
2.0
22
85
14
59
17
2
47
32
1.61
131272757--131273071
69
4.6
69
89
0
459
25
23
13
37
1.92
131276345--131276661
127
2.5
126
79
4
352
35
21
17
25
1.94
131277425--131277455
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
131277758--131277829
23
3.1
21
73
22
65
58
5
5
30
1.44
131279519--131279981
130
3.6
129
76
6
398
34
19
17
29
1.94
131282516--131282942
44
10.0
44
75
12
275
25
29
16
28
1.97
131282635--131282942
88
3.7
80
85
4
316
25
30
16
27
1.97
131282679--131282755
33
2.4
32
85
10
88
22
32
18
27
1.97
131282589--131282942
121
2.8
123
86
5
478
25
30
16
27
1.96
131282546--131282872
165
2.0
165
88
0
483
25
30
15
28
1.96
131282712--131282942
88
2.6
88
89
1
338
25
29
16
27
1.97
131282516--131282916
209
1.9
209
89
0
613
25
29
15
29
1.96
131292737--131292847
47
2.4
47
84
6
154
25
16
23
35
1.95
131297139--131297496
130
2.8
130
80
4
391
35
18
15
29
1.92
131300767--131301011
49
5.0
49
82
4
312
28
27
18
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131300781--131301011
99
2.3
99
88
3
340
29
27
18
24
1.98
131301652--131301711
30
2.0
30
83
6
77
30
25
8
36
1.85
131303376--131303405
15
2.0
15
93
0
51
16
0
13
70
1.18
131303644--131303674
15
2.0
16
93
6
55
58
0
0
41
0.98
131304634--131304678
8
5.9
8
78
19
51
2
13
0
84
0.72
131304634--131304678
15
2.9
15
87
12
65
2
13
0
84
0.72
131304627--131304670
11
4.1
11
83
16
56
0
13
0
86
0.57
131304627--131304678
26
2.0
26
85
7
70
1
13
0
84
0.70
131305507--131305567
18
3.3
18
73
15
54
29
1
3
65
1.18
131305615--131305664
22
2.5
20
84
12
66
22
14
4
60
1.51
131305658--131305720
3
21.3
3
96
3
119
31
0
0
68
0.90
131305808--131305865
9
6.6
9
77
16
50
20
8
0
70
1.13
131305808--131305868
25
2.6
24
84
7
81
21
8
0
70
1.13
131305807--131305852
15
3.0
16
84
6
60
19
10
0
69
1.17
131305814--131305868
16
3.3
16
75
9
56
21
7
0
70
1.11
131309400--131309684
135
2.1
137
96
1
520
31
24
18
24
1.98
131311460--131311543
26
3.2
26
91
0
141
35
23
5
34
1.80
131316499--131316562
4
16.0
4
100
0
128
25
0
25
50
1.50
131317201--131317240
5
7.8
5
94
5
71
80
0
0
20
0.72
131318608--131318724
30
3.8
30
89
8
182
26
50
3
19
1.63
131318608--131318724
62
1.9
60
89
6
182
26
50
3
19
1.63
131320386--131320438
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131325832--131325939
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
131329017--131329067
25
2.0
25
100
0
102
0
23
15
60
1.35
131329683--131329722
14
2.5
17
76
23
50
32
2
0
65
1.06
131330736--131330825
45
2.0
45
97
0
171
41
18
11
28
1.85
131330845--131330881
2
18.5
2
94
0
65
51
2
0
45
1.15
131332406--131332465
25
2.4
25
82
0
75
51
1
1
45
1.21
131335078--131335104
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
131335623--131335664
2
21.0
2
100
0
84
50
0
0
50
1.00
131335710--131335759
22
2.3
22
96
0
91
44
12
16
28
1.83
131340778--131340818
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433