Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  112  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34129450--34129486
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0
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0
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0
0
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0
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34138860--34138919
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2.8
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80
16
70
58
0
1
40
1.08
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0
0
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2
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2.0
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2.1
51
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0
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11
30
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18
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1.98
34152821--34153142
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6.8
48
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15
181
25
29
18
26
1.98
34158163--34158280
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2.9
40
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6
112
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25
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1.95
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1.9
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2.0
27
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20
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100
2.3
98
84
4
273
27
17
24
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.9
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23
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34177106--34177152
10
4.7
10
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0
58
21
27
17
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1.95
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20
2.3
20
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17
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12
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12
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4
52
68
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1.20
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2.0
896
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10
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1.95
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20
2.3
20
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1.96
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1.40
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2.7
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0
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10.0
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23
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1.9
80
83
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198
22
26
24
27
1.99
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555
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20
33
1.95
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25
2.4
25
94
0
102
48
38
8
5
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34200093--34200130
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67
57
1
18
21
1.48
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18
2.5
20
71
21
50
36
0
10
53
1.35
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22
4.5
21
77
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76
30
5
5
59
1.40
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3.5
24
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3
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1.37
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0
0
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26
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7
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1.58
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23
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23
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2.1
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16
23
1.87
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6
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6
96
0
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48
12
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21
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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35
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1
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28
19
1.98
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43
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1.99
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40
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1.80
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25
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0
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0
25
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1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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120
37
37
12
12
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.96
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0
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28
25
8
38
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433