Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  172  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53586349--53586386
14
2.9
13
81
11
51
18
13
10
57
1.63
53597523--53597571
21
2.4
20
90
6
80
22
8
6
63
1.44
53605671--53605714
16
2.8
15
86
10
61
47
20
0
31
1.50
53605671--53605713
15
2.7
16
89
7
61
48
20
0
30
1.50
53615768--53615813
19
2.2
20
81
14
58
34
2
4
58
1.30
53621257--53621299
21
2.0
21
100
0
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25
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9
41
1.84
53634595--53634627
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13
90
4
50
48
12
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1.40
53635895--53636009
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29
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13
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100
0
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1.84
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29
2.7
29
83
0
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29
27
15
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1.96
53639048--53639158
58
1.9
57
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1
150
27
28
15
27
1.96
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3.7
16
81
0
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10
16
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53639390--53639441
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2
52
11
15
23
50
1.76
53642339--53642463
64
2.0
64
82
3
153
26
28
9
35
1.88
53642412--53642480
29
2.4
29
85
2
95
26
27
10
36
1.88
53646060--53646181
43
2.9
42
82
9
158
30
17
23
28
1.97
53646632--53646810
18
9.9
18
89
4
265
36
11
14
37
1.82
53646632--53646810
35
5.0
36
91
4
274
36
11
14
37
1.82
53646632--53646810
53
3.3
54
92
3
283
36
11
14
37
1.82
53650257--53650322
33
2.0
33
93
0
114
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19
21
30
1.98
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72
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0
18
0
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53653248--53653317
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11.8
6
75
24
69
82
0
17
0
0.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53653258--53653317
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4.8
13
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17
83
81
0
18
0
0.69
53653235--53653317
36
2.3
37
89
8
127
81
0
18
0
0.68
53653246--53653317
20
3.3
22
80
11
85
81
0
18
0
0.68
53654960--53655131
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
53654952--53655127
46
3.8
46
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10
232
28
29
21
20
1.98
53657010--53657189
44
4.1
44
76
8
195
29
15
26
28
1.96
53657266--53657344
34
2.3
34
95
0
140
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18
16
31
1.94
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34
2.7
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116
32
20
16
31
1.94
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83
10.7
83
92
0
1421
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19
20
27
1.96
53659225--53659408
17
10.4
19
83
13
169
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12
11
36
1.80
53659233--53659410
35
5.0
35
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250
39
11
12
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1.81
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25
2.2
25
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6
65
33
9
0
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1.31
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43
2.8
42
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7
143
32
14
24
29
1.94
53676206--53676273
24
2.8
24
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2
82
27
25
22
25
1.99
53680944--53680991
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2.3
21
92
0
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56
4
0
39
1.19
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17
2.1
16
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5
52
57
0
20
22
1.41
53689329--53689415
43
2.0
43
88
4
131
24
24
22
28
1.99
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40
4.2
40
77
6
169
26
21
25
26
1.99
53696961--53697010
25
2.0
25
88
7
75
42
0
20
38
1.52
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51
2.0
51
97
0
191
37
7
17
39
1.76
53700155--53700378
40
5.6
40
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2
335
23
28
24
23
1.99
53708252--53708482
40
5.8
40
92
2
349
23
29
24
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53710974--53711140
46
3.6
45
80
15
198
21
21
29
27
1.99
53710974--53711140
47
3.6
45
81
15
191
21
21
29
27
1.99
53710970--53711140
92
1.8
93
93
1
299
21
21
29
26
1.99
53714384--53714574
40
4.8
39
78
7
172
23
28
24
24
1.99
53714424--53714574
78
1.9
80
85
5
209
23
28
23
25
1.99
53721613--53721687
29
2.6
29
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107
26
16
32
25
1.96
53729492--53729565
29
2.6
29
89
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105
25
16
32
25
1.96
53731171--53731350
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5.8
31
93
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306
26
18
27
27
1.98
53731370--53731491
47
2.6
47
89
1
174
29
14
26
29
1.95
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26
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1.9
18
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20
0
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19
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15
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22
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2.0
27
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101
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12
0
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1.42
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3.0
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0
0
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0
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21
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0
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7
0
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2.3
16
86
13
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8
0
2
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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70
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2.3
307
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150
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0
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50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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T
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1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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251
24
21
27
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433