Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  210  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65789058--65789139
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31
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1
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106
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26
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30
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28
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27
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2.3
20
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65795601--65795666
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20
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100
0
50
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1.02
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23
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1.9
28
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3
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12
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14
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48
15
0
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1.45
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0
102
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0
28
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25
17
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28
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30
2.7
30
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87
10
21
2
64
1.37
65805541--65805596
18
3.1
18
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51
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19
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1.27
65805566--65805590
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12
100
0
50
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0
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1.00
65805659--65805715
16
3.7
14
82
15
60
1
17
3
77
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
17
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65808145--65808192
20
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20
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0
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31
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1.96
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20
2.5
20
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1.90
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18
2.1
19
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53
7
23
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65809836--65809882
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18
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69
12
27
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20
2.4
21
83
9
59
9
25
0
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1.24
65809887--65809983
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2.3
42
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151
14
23
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19
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0
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65814052--65814108
12
4.8
12
73
0
51
10
28
0
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65814059--65814108
18
2.8
18
90
0
82
12
28
0
60
1.32
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3.2
21
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42
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13
22
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3.4
30
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26
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2.0
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3.2
30
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26
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5
12.0
5
83
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81
80
1
16
1
0.87
65829332--65829393
26
2.4
27
89
10
94
80
1
16
1
0.87
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24
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24
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61
0
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2.0
286
95
0
1036
33
12
28
25
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65832208--65832255
20
2.4
20
71
0
51
31
16
29
22
1.96
65833488--65833520
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12
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4
50
51
9
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36
1.49
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10
4.5
10
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56
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21
26
21
1.99
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20
2.8
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64
31
20
27
20
1.98
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3.2
30
71
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81
27
25
15
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1.96
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2.0
29
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70
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2.6
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248
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15
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100
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1.00
65860676--65860732
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17
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1.00
65860676--65860743
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11
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10
73
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55
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1
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3
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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65879655--65879711
5
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5
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1
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3
1.00
65879655--65879711
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28
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28
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27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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65911659--65911706
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65912632--65912688
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65912632--65912688
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0
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1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65944301--65944357
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1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433