Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  208  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65402853--65402909
5
11.0
5
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20
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1
17
3
77
1.00
65402853--65402909
16
3.7
14
82
15
60
1
17
3
77
1.00
65402853--65402920
21
3.2
21
76
15
61
1
17
4
76
1.03
65405529--65405625
30
3.2
30
77
2
106
28
15
26
28
1.96
65407208--65407267
30
2.0
31
83
3
77
45
18
21
15
1.86
65408901--65409071
93
1.8
92
92
1
288
22
20
29
28
1.98
65408905--65409078
46
3.8
46
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13
187
21
20
29
28
1.98
65413949--65414033
30
2.8
29
79
13
91
14
20
1
64
1.34
65413984--65414039
18
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18
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5
69
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17
1
71
1.21
65414007--65414033
12
2.2
12
100
0
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7
14
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14
2
80
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16
2.7
15
83
13
59
2
13
2
81
0.89
65414102--65414148
21
2.2
21
85
7
60
2
14
2
80
0.89
65414102--65414159
18
3.0
20
72
27
54
1
15
5
77
1.02
65416686--65416782
30
3.2
30
70
8
81
28
14
28
27
1.95
65426001--65426032
13
2.5
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0
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25
1.95
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2.2
16
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0
54
19
11
13
55
1.68
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13
1.9
13
100
0
50
16
32
16
36
1.90
65431591--65431751
77
2.1
77
83
4
209
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6
10
35
1.63
65431743--65431800
11
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62
79
5
0
15
0.90
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86
78
6
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16
0.95
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17
2.1
17
89
0
54
55
8
19
16
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65433908--65433940
11
2.8
12
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9
50
42
0
39
18
1.50
65435511--65435706
49
4.0
49
83
2
248
29
26
19
25
1.98
65435507--65435704
100
2.0
100
92
0
333
29
25
20
24
1.99
65436027--65436093
35
1.9
35
90
0
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49
13
2
34
1.57
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30
2.0
30
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28
25
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37
1.85
65445035--65445088
23
2.3
23
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3
54
48
12
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33
1.65
65446455--65446494
19
2.1
19
85
0
53
25
35
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22
1.95
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28
28
13
30
1.94
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2.1
18
100
0
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28
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10
50
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30
3.3
30
77
0
106
28
16
27
27
1.97
65454261--65454343
30
2.7
30
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89
13
21
1
63
1.35
65454319--65454350
12
2.7
12
95
0
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9
15
3
71
1.24
65454412--65454457
15
3.1
14
84
12
56
4
17
2
76
1.06
65454412--65454474
15
4.0
16
78
13
51
3
17
3
76
1.05
65455491--65455520
15
2.0
15
93
0
51
16
0
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0.99
65457061--65457158
30
3.3
30
80
0
115
27
16
28
27
1.97
65457075--65457170
30
3.2
29
77
11
79
26
16
32
25
1.96
65458047--65458101
20
2.8
20
81
15
69
78
5
16
0
0.93
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15
51
79
2
17
0
0.84
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2.7
29
81
7
99
62
0
24
12
1.29
65461022--65461118
30
3.2
30
70
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81
28
14
28
27
1.95
65462580--65462604
13
1.9
13
100
0
50
64
8
0
28
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65462826--65462874
10
4.8
10
80
14
55
40
22
22
14
1.90
65462826--65462874
21
2.4
21
89
3
73
40
22
22
14
1.90
65464071--65464157
30
2.9
29
76
8
86
31
25
14
28
1.95
65464789--65464828
19
2.1
19
86
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55
27
35
15
22
1.94
65466068--65466115
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3.4
14
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0
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18
31
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43
1.75
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2.5
16
100
0
80
75
0
15
10
1.05
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10
3.8
10
86
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60
79
7
2
10
1.02
65466503--65466543
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3.8
11
83
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57
80
7
2
9
0.99
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19
2.1
19
86
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55
27
35
15
22
1.94
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14
3.4
14
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18
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1.75
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29
27
14
29
1.95
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100
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18
1.85
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10
2.7
10
100
0
54
40
29
11
18
1.85
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2.0
26
100
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93
93
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29
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20
22
1.98
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46
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26
19
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100
0
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1.94
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71
2.8
70
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3
258
20
28
17
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1.95
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2
8
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1.9
13
100
0
50
16
32
16
36
1.90
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18
1.9
18
88
5
54
11
0
13
75
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2
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2
1.00
65520825--65520887
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0
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16
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
14
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
21
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433