Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  425  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
130472161--130472211
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16
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0
0
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0
0
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0.99
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5.0
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1.99
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58
2.8
58
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2
184
26
22
23
27
2.00
130474687--130474927
15
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24
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1.99
130474742--130474868
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24
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2.00
130474688--130474913
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18
18
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39
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2.3
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2.5
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1.00
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0
0
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43
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4
0
30
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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188
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2.0
21
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2.0
22
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0
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2.0
21
90
4
68
45
4
7
42
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
130551854--130551894
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63
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2.0
30
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39
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42
1.68
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0
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1.00
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6
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21.0
2
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0
2
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1.14
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1.8
142
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5
371
25
6
21
45
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
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27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0.50

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433