Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  368  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115522539--115522708
92
1.8
93
93
1
297
27
28
22
21
1.99
115523127--115523186
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
115526314--115526352
21
1.9
20
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15
53
61
2
5
30
1.31
115538309--115538534
40
5.7
40
90
4
289
26
26
20
25
1.99
115544834--115544863
16
1.9
16
93
6
53
83
0
10
6
0.81
115544834--115544877
14
2.9
15
86
6
54
79
2
9
9
1.02
115544851--115544900
15
3.4
15
84
13
59
74
2
4
20
1.08
115544868--115544936
23
3.1
23
74
12
63
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0
4
24
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20
70
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1
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19
1.08
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22
2.5
20
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11
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75
1
0
23
0.91
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1.9
30
85
0
80
13
25
37
22
1.91
115554957--115555084
64
2.0
64
100
0
256
40
18
9
31
1.83
115562974--115563028
22
2.5
22
85
5
76
43
18
25
12
1.85
115563371--115563395
3
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100
0
50
32
0
0
68
0.90
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2.6
29
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26
16
32
25
1.96
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2
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2
100
0
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0
0
51
1.00
115573573--115573647
29
2.6
29
89
4
107
26
16
32
25
1.96
115575233--115575326
7
13.3
7
74
16
52
50
1
1
47
1.15
115575235--115575323
39
2.5
33
84
12
99
51
1
1
46
1.15
115582114--115582347
55
4.4
53
79
9
255
35
17
25
20
1.95
115582121--115582321
108
1.8
110
89
4
318
34
17
25
21
1.96
115582434--115582478
23
1.9
24
90
4
74
42
11
24
22
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115582551--115582582
16
2.0
16
93
0
55
40
0
15
43
1.47
115591543--115591690
57
2.6
57
76
3
163
31
13
23
31
1.93
115597816--115597875
30
2.0
30
100
0
120
33
20
16
30
1.94
115598055--115598170
41
2.8
41
88
0
178
23
20
27
28
1.99
115598779--115598899
41
3.0
41
87
7
192
24
26
23
24
2.00
115599159--115599374
27
8.0
27
79
3
155
31
11
18
39
1.85
115599138--115599374
81
2.9
79
73
10
190
31
10
18
39
1.85
115599136--115599376
27
8.9
27
76
2
110
31
11
18
38
1.86
115601874--115602083
40
5.2
40
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2
305
25
24
28
21
1.99
115610010--115610219
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
115621453--115621624
93
1.8
93
94
0
308
27
30
21
20
1.98
115621446--115621621
46
3.8
45
80
10
203
28
30
21
20
1.98
115625336--115625502
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
115633332--115633473
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3.5
40
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1
124
27
23
26
22
1.99
115633371--115633499
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
115635203--115635265
15
4.2
15
78
8
74
55
14
17
12
1.69
115635192--115635256
30
2.2
29
83
2
85
58
12
18
10
1.62
115638224--115638395
93
1.8
93
93
0
299
27
30
20
20
1.98
115638217--115638392
46
3.8
45
78
10
194
28
30
20
20
1.98
115646756--115646797
16
2.4
18
77
22
54
45
11
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35
1.69
115647614--115647774
27
6.0
27
90
0
232
44
19
13
23
1.85
115650533--115650699
40
4.2
40
79
3
160
25
22
27
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115656173--115656230
29
2.0
29
96
0
107
50
3
18
27
1.63
115659546--115659622
40
1.9
40
100
0
154
28
25
18
27
1.98
115665342--115665509
46
3.6
46
76
13
191
22
21
27
28
1.99
115665339--115665510
93
1.8
93
93
0
299
22
21
28
27
1.99
115671353--115671545
40
4.8
40
84
0
215
27
22
24
24
2.00
115676142--115676317
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3.8
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79
12
207
20
20
29
29
1.98
115676139--115676308
93
1.8
93
96
0
313
21
21
29
28
1.98
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26
2.3
27
81
10
74
35
27
11
25
1.90
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4.2
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115
21
21
20
37
1.94
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2.9
28
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9
101
18
20
22
37
1.94
115684755--115684861
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4.0
26
81
11
117
19
20
21
38
1.94
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2.5
10
100
0
50
28
0
0
72
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18
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22
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25
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1.96
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278
24
24
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24
2.0
24
83
8
60
27
23
19
29
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115726526--115726583
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2.8
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5
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115726531--115726583
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18
13
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5.9
45
79
8
230
24
17
27
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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26
1.98
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1.96
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1.97
115745287--115745386
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1.99
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23
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1
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0
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0
5
0
0.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
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1.97
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1.97
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1.92
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257
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195
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5
13
76
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.08
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1.99
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1.99
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28
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0
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0
0
16
0.63

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433