Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  1  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1125--1291
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35
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24
10
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1.90
1120--1291
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2.4
73
84
8
226
33
23
11
31
1.90
8618--8784
35
4.6
35
85
7
201
33
24
10
31
1.90
8613--8784
75
2.4
73
84
8
226
33
23
11
31
1.90
11097--11396
73
4.2
70
81
8
300
26
16
23
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1.95
11097--11401
146
2.1
144
86
6
413
26
16
23
33
1.95
11392--11427
14
2.6
14
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0
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22
25
0
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11097--11413
142
2.2
144
84
6
410
26
16
22
34
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11481--11507
13
2.1
13
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0
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29
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0
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0
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20
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87
6
52
32
0
0
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2
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0
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45
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0
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21
2.0
22
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4
72
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15
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23862--23895
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2.1
16
100
0
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0
11
0
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0.52
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0
25
0
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40
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189
25
22
27
25
2.00
35888--35922
4
9.2
4
87
12
56
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0
25
0
0.82
38137--38178
21
2.0
21
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4
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1.12
40028--40135
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3.2
33
76
10
101
31
13
16
37
1.88
41661--41726
32
2.0
32
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8
80
42
4
4
48
1.44
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28
2.8
28
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19
74
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2
0
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1.14
47004--47040
19
1.9
19
88
0
56
54
2
0
43
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
47128--47171
22
2.0
22
82
8
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4
2
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1.33
47777--47809
13
2.6
13
90
4
50
45
0
0
54
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10
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10
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15
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36
4
0
59
1.19
48071--48125
9
5.9
9
75
8
56
36
1
0
61
1.06
48071--48155
39
2.2
39
81
10
95
36
4
0
58
1.19
48488--48558
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2.3
31
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13
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40
9
1
47
1.45
53663--53825
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3.5
46
90
0
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19
20
14
46
1.84
53797--53922
45
2.8
45
86
0
180
23
23
15
38
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53751--53939
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16
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55635--55670
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0
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1.9
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84
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16
1
49
1.56
55933--56001
30
2.3
31
82
7
79
31
15
4
47
1.65
68002--68083
24
3.4
24
75
9
76
37
0
3
58
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72367--72406
21
2.0
20
85
5
53
40
2
0
57
1.12
72381--72421
13
2.7
15
85
14
50
39
0
0
60
0.96
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2.0
35
97
0
131
31
24
2
41
1.69
77562--77599
11
3.5
11
78
7
51
63
7
2
26
1.35
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20.0
3
100
0
120
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0
0
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2.0
30
93
0
100
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5
11
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1.54
95572--95607
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6.3
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12
58
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13
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36
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95558--95606
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2.9
16
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71
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16
2
32
1.57
97641--97689
16
3.2
16
75
16
50
26
6
2
65
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109290--109326
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2.3
16
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0
56
29
5
10
54
1.57
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2.0
23
81
0
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31
0
8
60
1.28
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2
15.0
2
100
0
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0
0
50
1.00
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100
0
224
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9
21
29
1.85
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100
0
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51
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0
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13
100
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7
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2.0
168
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1
575
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15
23
32
1.95
136961--137059
49
2.1
46
90
9
157
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6
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1.63
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1.9
22
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0
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47
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2
45
1.36
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12
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21
20
28
29
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1.8
93
93
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299
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20
29
28
1.98
145915--145967
21
2.5
21
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0
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37
9
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1.86
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3.2
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14
51
29
0
0
70
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16
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4
51
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1
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9
11
27
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
181757--181806
22
2.2
22
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0
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1.10
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0
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0
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0
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0
51
1.00
192794--192823
12
2.4
13
94
5
53
63
0
3
33
1.11
198059--198230
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
198052--198227
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
205611--205782
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
205604--205779
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3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
208319--208403
43
2.0
43
100
0
170
40
21
17
21
1.92
210535--210625
44
2.1
44
93
0
155
29
16
14
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1.88
213463--213553
46
2.0
46
95
0
164
50
10
5
32
1.61
215515--215848
167
2.0
170
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1
467
43
13
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26
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12
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12
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13
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25
5
7
61
1.44
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20
1.9
20
88
0
58
18
0
7
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1.06
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20
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20
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4
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0
11
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2.0
33
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3
4
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1.38
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18
2.3
18
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0
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1.75
235977--236026
9
5.7
9
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4
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44
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10
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1.81
236045--236087
20
2.2
20
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0
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18
2
2
76
1.00
237453--237483
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0
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38
0
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25
2.4
25
97
0
109
8
13
30
47
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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6
53
20
0
13
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2.0
26
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0
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1.77
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15
2.5
16
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4
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2
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21
2.0
21
90
0
64
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24
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1.97
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6
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6
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20
1.55
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6
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6
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20
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1.9
93
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1.98
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19
1.97
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45
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29
29
20
20
1.98
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1.9
93
95
0
310
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19
1.98
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3.8
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10
214
28
30
21
19
1.97
331344--331487
46
3.1
45
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11
139
29
29
20
20
1.98
332998--333050
27
2.0
27
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35
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15
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0
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2.0
22
100
0
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4
0
54
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
349465--349495
14
2.3
14
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0
0
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0.87
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1.9
16
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0
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0
0
70
0.87
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36
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0
188
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10
28
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1.90
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1.8
285
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1
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14
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2.0
33
100
0
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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1.9
22
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0
0
52
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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