Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  4  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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109
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1.9
23
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22
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28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.9
29
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0
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0
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1254565--1254593
14
2.1
14
100
0
58
34
17
6
41
1.76
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2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
1258287--1258320
5
6.8
5
96
0
50
26
20
32
20
1.97
1272435--1272469
7
5.0
7
100
0
70
28
14
14
42
1.84
1272434--1272481
21
2.3
21
82
7
62
22
16
16
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1.87
1272874--1272916
20
2.2
20
82
0
50
53
6
0
39
1.28
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16
2.0
16
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0
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51
2.1
51
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0
203
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27
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35
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0
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2.0
50
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0
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24
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0
0
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22
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0
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2.0
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2.3
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1.60
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27
2.1
27
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1.99
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2
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0
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0
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2.1
39
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0
121
21
39
15
22
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
16
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0
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0
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16
3.2
16
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0
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11
5
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1.9
21
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0
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0
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1.9
103
100
0
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2.0
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24
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1.94
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18
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16
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33
1.94
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143
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30
16
19
33
1.94
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2.6
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676
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16
19
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1.94
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0
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0
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15
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0
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0
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2
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33
33
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20
1.90
1410764--1410802
18
2.2
18
95
0
69
48
17
25
7
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1418439--1418515
40
1.9
40
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0
109
29
14
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2.0
17
100
0
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17
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2.0
15
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0
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40
10
0
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0
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0
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0
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0
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1.28
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2.3
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10
63
50
12
0
36
1.41

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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