Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  5  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1435643--1435837
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0
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2.1
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16
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1
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12
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879
89
3
6747
34
9
12
43
1.76
1472173--1472256
42
2.0
42
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0
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21
13
33
32
1.91
1473668--1473719
20
2.6
21
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11
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10
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1
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0
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20
3.0
20
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0
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0
8
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20
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20
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60
25
12
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76
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77
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19
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31
93
3
106
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16
3
4
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1508470--1508503
6
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0
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0
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2.1
19
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4
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58
12
0
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20
2.1
20
86
0
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11
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16
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78
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2.0
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20
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2.0
37
94
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100
0
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21
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2.0
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100
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29
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2.0
54
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0
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10
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8
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1537436--1537578
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2.0
73
97
0
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14
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2.0
21
90
0
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21
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40
28
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13
1.9
13
100
0
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44
16
0
40
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3
133.7
3
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14
154
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1
7
31
1.38
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29
2.4
28
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15
70
63
2
4
29
1.29
1561665--1561723
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3.5
17
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11
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55
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10
30
1.49
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19
2.1
19
90
0
60
23
7
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2.0
21
90
0
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29
21
29
19
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1596949--1597595
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1.8
356
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10
13
39
1.80
1598078--1598714
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3.4
189
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1
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18
18
31
1.95
1600590--1600682
18
5.2
18
78
0
105
30
21
13
34
1.92
1600596--1600682
36
2.4
36
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120
31
20
12
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1.90
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10
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10
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1
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2
0
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1.09
1606576--1606647
19
3.8
20
71
15
64
34
1
1
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1.13
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0
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0
0
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1.00
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189
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18
18
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21
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2.0
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29
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9
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0
8
0
91
0.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1660534--1660620
6
13.7
6
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20
72
77
0
3
19
0.92
1660535--1660620
13
6.7
13
73
22
58
76
0
3
19
0.92
1660540--1660617
19
3.9
19
75
19
72
75
0
3
20
0.95
1660535--1660624
35
2.8
30
78
18
110
76
0
4
18
0.95
1667037--1667098
27
2.3
26
76
13
63
48
11
1
38
1.49
1669870--1669978
50
2.2
51
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3
184
36
15
22
25
1.93
1669974--1670122
31
4.8
31
87
3
210
26
17
26
28
1.98
1670140--1670252
47
2.4
46
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2
154
28
15
27
29
1.96
1670222--1670316
49
2.0
48
91
2
154
26
11
28
33
1.91
1674332--1674400
29
2.4
28
85
9
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20
1
1
76
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14
2.4
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10
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0
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3
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15
2.0
15
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0
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0
10
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1.36
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24
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0
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39
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18
33
1.81
1681445--1683248
422
4.2
425
88
5
2492
34
9
13
42
1.77
1689800--1690035
20
11.6
19
67
23
74
60
1
3
33
1.25
1689900--1690021
3
40.7
3
67
26
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1
3
32
1.21
1689841--1690045
30
6.7
30
72
19
133
60
1
2
34
1.20
1689841--1690046
18
11.0
18
68
19
86
61
1
2
34
1.20
1696703--1696728
11
2.4
11
100
0
52
7
7
0
84
0.77
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25
1.9
25
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30
15
0
54
1.41
1706721--1707032
46
7.0
46
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22
24
14
38
1.92
1706946--1707021
38
2.0
38
97
0
143
23
26
17
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1713875--1713915
19
2.2
19
95
0
73
41
9
2
46
1.50
1727489--1727602
38
3.0
38
100
0
228
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15
10
39
1.82
1744610--1744698
19
4.8
19
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8
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37
11
13
38
1.81
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5
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75
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0
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0
0.66
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0
17
0
0.66
1750409--1750490
31
2.7
31
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7
105
82
0
17
0
0.66
1750411--1750490
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3.6
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12
101
82
0
17
0
0.67
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3.3
43
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132
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23
1.97
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2.5
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84
8
271
32
23
21
22
1.98
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207
5.5
207
95
0
1997
29
18
23
29
1.97
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19
5.8
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18
76
38
10
14
37
1.80
1753275--1753380
17
5.8
19
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10
141
38
10
14
36
1.80
1753283--1753380
35
2.8
36
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144
38
11
13
36
1.80
1754946--1755012
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2.2
30
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2
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11
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20
1.56
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15
100
0
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1.67
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0
0
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0
0
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1772270--1772300
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0
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0
0
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0
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0
0
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1782587--1782696
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2.9
38
87
0
148
18
24
15
41
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1783885--1784022
46
3.0
47
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2
165
21
22
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42
1.89
1783998--1784051
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1.9
28
100
0
108
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1.82
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2.0
74
92
0
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24
22
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40
1.88
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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0
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0
0
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0
0
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0
0
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0.90
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2.5
11
100
0
56
35
0
7
57
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444