Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  366  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106473539--106473661
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2.1
59
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0
228
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0
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48
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0
0
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1.00
106473624--106473654
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2.4
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0
53
48
0
0
51
1.00
106474156--106474196
22
1.9
21
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5
64
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2.5
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75
0
24
0
0.80
106475215--106475314
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2.5
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22
20
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0
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1.17
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107
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26
16
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1.97
106484363--106484560
105
1.9
101
84
8
265
25
26
17
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1.97
106497131--106497160
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5.0
6
95
0
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0
50
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2.6
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11
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60
2
0
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1.11
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22
1.23
106501083--106501131
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2.9
17
85
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66
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22
1.21
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2.0
44
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0
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43
12
9
35
1.74
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2.0
27
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67
27
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10
1.88
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108
2.0
108
99
0
425
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43
1.61
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2.6
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17
52
61
2
0
35
1.09
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2.8
16
83
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58
63
2
0
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1.06
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4.2
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100
0
50
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0
0
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0
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51
1.64
106528758--106528796
12
3.2
12
92
0
69
5
15
28
51
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106530326--106530380
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2.6
21
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1
1
56
1.21
106530755--106530793
14
2.7
15
88
4
53
58
2
0
38
1.12
106530846--106530898
21
2.5
21
90
6
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60
0
0
39
0.97
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34
1.9
35
91
8
111
59
0
0
40
0.97
106530895--106530962
23
3.0
22
81
10
82
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1
0
44
1.09
106530897--106530984
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1.9
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55
1
0
43
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106534209--106534247
20
2.0
20
89
0
60
61
2
2
33
1.23
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3.5
20
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10
61
53
4
2
38
1.36
106534303--106534354
20
2.9
17
76
18
52
53
1
3
40
1.30
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24
2.0
24
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0
10
14
1.06
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200
35
13
20
30
1.91
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3.7
75
75
10
227
36
13
20
29
1.91
106539056--106539483
38
11.7
35
71
9
239
36
13
20
29
1.90
106543642--106543674
17
1.9
17
93
0
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24
3
6
1.28
106548853--106548903
26
2.0
26
84
0
66
50
1
3
43
1.31
106548971--106549003
15
2.1
16
88
5
50
84
3
12
0
0.72
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14
4.2
14
81
8
68
46
35
0
18
1.49
106551700--106551754
21
2.6
21
88
2
74
47
30
0
21
1.51
106551672--106551754
29
2.9
29
82
8
107
46
32
0
20
1.51
106551649--106551753
7
14.3
7
73
15
52
47
32
0
19
1.56
106551656--106551753
15
6.6
14
75
13
81
47
32
1
18
1.55
106551913--106551970
7
8.0
7
84
7
80
43
39
0
17
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106552198--106552802
264
2.3
266
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4
853
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15
25
1.95
106552698--106552893
91
2.2
91
91
1
313
32
23
16
28
1.96
106552298--106552802
132
3.8
132
90
1
764
35
24
14
25
1.94
106552811--106553031
120
1.9
120
87
2
329
30
24
17
28
1.97
106553191--106553259
26
2.7
24
82
10
75
65
1
7
26
1.27
106553510--106553547
15
2.5
15
80
16
51
52
0
13
34
1.40
106553637--106553693
25
2.3
26
87
6
82
54
5
5
35
1.46
106553650--106553745
47
2.1
46
84
11
126
59
4
3
33
1.32
106553721--106553773
15
3.2
17
81
13
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67
3
0
28
1.07
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1.10
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25
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15
74
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0
2
32
1.06
106556802--106556854
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17
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1
49
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86
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1
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1.02
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0
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2.5
26
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2
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1
31
0
66
1.01
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0
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0
68
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5.6
5
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0
56
0
17
0
82
0.68
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1.9
21
84
0
53
7
7
2
82
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
20
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2
0
70
1.01
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27
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2
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176
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0
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132
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21
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1.98
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4.7
173
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583
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22
19
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1.96
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256
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20
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2
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2
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0
0
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2.0
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0
0
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1.94
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1.95
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12
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2.0
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14
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2.2
19
91
4
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29
29
24
17
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
30
1.97
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72
4.5
75
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6
422
29
20
18
30
1.97
106624758--106625124
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2.5
148
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437
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19
19
30
1.96
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1
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0
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0.72
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36
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25
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7
0
17
1.02
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0
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1.55
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2.1
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0
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1.56
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0
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3.0
56
89
3
233
33
0
16
50
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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132
32
0
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1.48
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0
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1.9
114
82
7
272
38
23
12
26
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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