Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  82  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19361908--19361961
19
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19
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0
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2.0
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0
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26
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32
5
25
36
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19390335--19390493
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2.1
77
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277
32
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1.79
19391665--19391700
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8
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2.2
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0
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27
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16
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23
36
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19392110--19392224
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2.1
54
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16
23
23
36
1.94
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2.0
17
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50
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10
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38
21
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30
1.85
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2.6
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113
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20
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19412302--19412360
23
2.6
21
82
15
73
33
16
22
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19412309--19412396
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22
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2.0
23
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24
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20
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1.95
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2.8
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23
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19431393--19431443
21
2.5
21
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19
1
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1.63
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58
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2.5
23
77
14
62
30
1
7
60
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19451829--19451869
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20
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1.15
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17
1.25
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17
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19468312--19468783
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3.6
131
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17
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0
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0
0
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Period
Size
Copy
Number
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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(0-2)
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18
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1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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20
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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38
12
4
43
1.64

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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