Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  365  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106120369--106120651
102
2.7
102
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3
467
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18
14
29
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106120692--106120910
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3.0
72
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0
330
34
17
15
31
1.92
106120695--106121190
280
1.8
273
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5
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15
29
1.94
106120950--106121175
76
2.9
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5
323
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27
1.96
106121179--106121209
16
1.9
16
93
0
53
64
6
12
16
1.47
106121113--106121373
89
2.9
88
91
2
425
36
20
16
26
1.94
106121278--106121513
73
3.2
73
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330
33
20
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28
1.95
106123668--106123730
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0
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0.73
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0.76
106123666--106123731
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2.8
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84
6
80
0
9
6
84
0.76
106127624--106127729
3
34.7
3
76
14
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2
3
32
1.28
106127774--106127845
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1.9
37
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10
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58
5
5
30
1.44
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2.0
43
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10
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17
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50
2.2
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1
179
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1.97
106138525--106138641
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3.8
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0
207
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2.0
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2.0
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18
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10
10
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1.9
20
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0
58
26
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44
1.79
106165811--106165850
20
2.0
20
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0
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42
0
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0
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0
0
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1.00
106176029--106176070
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7.0
6
91
0
66
16
28
50
4
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106176029--106176069
12
3.4
12
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0
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17
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51
4
1.65
106184948--106185055
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
106185545--106185590
22
2.1
22
100
0
92
43
8
10
36
1.71
106186672--106186807
27
5.1
26
79
9
130
20
25
21
33
1.97
106186673--106186815
54
2.6
54
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6
155
20
24
21
33
1.97
106189675--106189822
43
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8
156
27
16
24
31
1.96
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8
3.1
8
100
0
50
48
0
24
28
1.52
106195702--106195764
28
2.2
29
78
10
69
63
7
3
25
1.37
106196301--106196564
3
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3
70
10
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27
5
5
61
1.40
106196850--106196886
18
2.1
18
85
14
51
32
10
2
54
1.49
106197028--106197088
29
2.1
30
82
8
74
31
9
6
52
1.60
106197194--106197223
2
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2
100
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0
0
50
1.00
106198507--106198620
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2.7
43
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2
140
28
16
22
31
1.96
106199616--106199649
15
2.3
15
94
0
59
29
29
14
26
1.95
106208202--106208399
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
106208268--106208385
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
106208236--106208399
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
106215267--106215464
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
106215333--106215450
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
106215301--106215464
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
106216528--106216712
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1.9
100
90
0
298
35
28
11
24
1.91
106217825--106217885
12
5.2
11
72
20
52
72
1
1
24
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106217828--106217878
13
3.8
13
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19
59
72
1
1
23
1.05
106217815--106217878
20
3.2
20
78
15
69
71
1
3
23
1.08
106217824--106217888
10
6.8
10
69
20
50
70
1
1
26
1.04
106217817--106217911
28
3.5
26
79
11
75
72
1
4
22
1.08
106224320--106224622
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47
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225
24
28
18
27
1.98
106224320--106224586
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2.8
94
75
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250
24
29
18
27
1.98
106224318--106224635
144
2.2
144
79
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338
26
28
18
27
1.98
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106226730--106226790
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0
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16
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50
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137
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0
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24
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1.97
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4.7
35
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1
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31
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14
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0
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28
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0
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0
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0
30
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2.4
13
94
0
53
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3
3
32
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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(0-2)
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31
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.85
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2.5
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53
48
4
0
46
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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