Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  138  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36739632--36739874
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24
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0
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24
10.1
24
97
0
423
20
18
25
36
1.95
36754122--36754378
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3.2
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2.00
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1.8
119
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400
22
23
27
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2.00
36754122--36754378
119
2.2
120
90
4
396
23
22
27
26
2.00
36754122--36754378
40
6.5
40
91
2
394
23
22
27
26
2.00
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4.6
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4
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28
22
26
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1.99
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174
28
22
26
23
1.99
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84
2.3
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197
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14
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1.94
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28
5.8
28
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4
157
34
22
15
27
1.94
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0
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2.1
20
100
0
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2.4
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100
0
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22
22
0
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32
25
20
22
1.98
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4.9
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27
19
28
1.99
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96
2.5
96
86
4
341
25
27
19
28
1.99
36799294--36799386
28
3.3
28
96
0
168
34
26
7
31
1.84
36799492--36799573
28
3.0
27
83
7
103
21
25
20
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36799492--36799606
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2.1
56
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24
20
35
1.96
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30
5.8
30
90
2
271
24
48
4
22
1.68
36801374--36801547
60
2.9
60
96
2
316
24
48
4
22
1.68
36802037--36802166
23
5.5
23
69
17
72
35
4
3
56
1.35
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25
5.7
25
73
13
84
35
7
4
53
1.48
36802112--36802219
25
4.0
26
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36
5
2
55
1.38
36802137--36802201
33
2.0
33
84
6
87
36
4
1
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1.29
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25
2.0
25
91
0
80
34
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51
1.57
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16
3.1
15
90
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69
31
2
2
64
1.16
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8
6.5
8
82
8
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30
1
1
65
1.14
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12
3.0
12
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0
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25
5
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2.5
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91
0
293
28
15
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31
1.96
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241
2.4
240
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2
860
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16
21
34
1.95
36808051--36808078
14
2.0
14
100
0
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14
21
7
57
1.61
36807919--36808069
74
2.0
74
87
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216
26
18
21
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1.97
36807993--36808162
92
1.9
90
85
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225
28
17
20
33
1.95
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405
2.4
406
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0
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16
21
33
1.95
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5.9
73
75
13
401
27
16
22
33
1.95
36808290--36808316
14
1.9
14
100
0
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14
18
7
59
1.58
36807919--36809272
479
2.8
478
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1
2419
27
16
21
34
1.95
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14
2.0
14
100
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21
21
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3.0
72
88
3
313
27
17
21
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36807919--36809272
238
5.7
239
95
1
2403
27
16
21
34
1.95
36808562--36808779
73
2.9
73
90
2
319
27
16
22
33
1.96
36808767--36808794
14
2.0
14
100
0
56
14
21
7
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1.61
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1.9
166
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2
505
28
16
21
32
1.96
36808803--36809020
73
2.9
73
91
2
337
27
16
22
33
1.96
36809008--36809035
14
2.0
14
100
0
56
14
21
7
57
1.61
36808877--36809183
163
1.9
162
87
6
451
28
16
22
32
1.95
36809025--36809264
75
3.2
73
81
10
281
28
15
21
34
1.94
36809241--36809282
14
2.9
15
85
7
59
14
14
7
64
1.48
36809244--36809293
14
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14
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12
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64
1.43
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22
1.65
36810039--36810213
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2.9
60
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25
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1.65
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16
28
0
1.41
36819863--36820032
40
4.2
42
79
9
151
25
21
27
25
2.00
36819901--36820032
42
3.2
40
84
7
142
23
21
28
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
52
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0
203
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29
1.97
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28
2.5
28
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2
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10
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1.82
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28
3.5
28
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27
15
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30
1.96
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48
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21
24
28
1.99
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40
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2
284
24
21
26
27
1.99
36847068--36847357
80
3.7
80
85
2
329
25
21
25
27
2.00
36847225--36847357
40
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38
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24
24
27
23
2.00
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2.0
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0
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1.80
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1.96
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1.98
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20
20
1.97
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2.1
55
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18
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1.97
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2.1
19
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0
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1.14
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25
20
23
29
1.99
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2.5
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20
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1.99
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1.9
80
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30
24
22
1.99
36896902--36897009
40
2.7
38
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128
21
29
25
23
1.99
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4.8
46
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30
28
19
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1.98
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2.0
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1.85
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40
4.2
40
82
1
176
24
27
22
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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1.98
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3.8
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1.98
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22
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1.99
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17
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0
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0
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1.92
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1.9
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0
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1.88
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2.3
72
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0
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1.98
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1.98
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20
1.98
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1.8
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28
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20
1.98
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1.98
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1.98
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104
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0
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2.0
29
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0
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10
7
61
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36963001--36963064
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2.0
32
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0
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1.13
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1.26
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2
0
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1.14
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30
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23
1.99
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39
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0
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1.98
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2.00
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2.00
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3.6
10
84
7
54
37
2
28
31
1.72

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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