Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  88  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20988090--20988204
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26
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23
23
16
1.94
20988090--20988204
54
2.1
54
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169
36
23
23
16
1.94
20989820--20989955
26
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0
236
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2.0
56
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19
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20991357--20991410
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0
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1
61
1.07
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1.9
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0
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0.94
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62
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20
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2
3
59
1.28
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19
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18
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2
2
62
1.21
21015705--21015789
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2.2
38
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118
32
2
2
62
1.21
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20
1.9
21
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38
0
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22
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65
40
1
3
54
1.27
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20
4.8
20
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16
52
36
1
4
58
1.25
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93
2.5
93
85
1
315
32
6
16
44
1.74
21019050--21019310
93
2.8
93
81
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305
31
6
16
45
1.73
21020175--21020225
16
3.4
16
68
15
54
49
7
7
35
1.61
21020173--21020228
29
1.9
29
100
0
112
51
7
7
33
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21020162--21020227
29
2.5
26
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17
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51
6
9
33
1.58
21032330--21032418
36
2.6
35
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7
128
24
8
5
60
1.48
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39
2.0
39
100
0
156
46
7
25
20
1.77
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21
4.5
21
90
0
134
32
26
24
15
1.96
21036298--21036405
42
2.6
42
89
0
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35
25
23
15
1.94
21036775--21036832
15
3.8
15
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2
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0
0
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0
56
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0
0
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431
30
19
25
24
1.98
21052291--21052657
154
2.4
155
81
7
431
31
20
25
22
1.98
21052582--21052693
40
2.8
39
82
6
116
29
20
25
25
1.99
21053036--21053062
2
13.5
2
100
0
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0
0
51
1.00
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0
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1.47
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14
2.2
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51
50
0
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100
0
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20
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2.5
273
99
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13
37
1.84
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24
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102
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20
7
44
1.78
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9
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9
76
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143
47
12
0
38
1.48
21058006--21058231
18
12.3
18
75
9
161
47
12
0
38
1.48
21058034--21058255
114
1.9
114
86
3
313
47
12
0
38
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21063867--21063917
21
2.4
21
80
0
66
29
19
49
1
1.60
21064315--21064512
43
4.6
43
93
1
342
24
33
19
22
1.97
21078097--21078148
24
2.1
25
85
3
70
67
3
0
28
1.08
21079531--21079574
10
4.4
10
83
11
54
65
6
0
27
1.17
21079503--21079545
19
2.2
20
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60
2
2
34
1.22
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21
2.0
21
85
0
55
53
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1.22
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20
1.9
19
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5
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1.24
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1.83
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22
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19
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10
16
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19
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22
2.2
22
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0
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24
24
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24
2.1
23
82
10
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60
2
2
36
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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40
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29
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28
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1.98
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20
1.98
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29
28
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51
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0
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1
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53
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21186919--21186972
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25
16
27
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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