Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  50  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12010125--12010171
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2.2
21
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0
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0
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2.2
27
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0
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0
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0
22
0
78
0.76
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0
24
0
75
0.80
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4
10.0
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0
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0
0
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18
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18
18
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578
32
17
18
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282
2.0
282
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2
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17
18
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2.1
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0
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51
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22
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20
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2
2
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4.2
26
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0
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23
36
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27
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2.0
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19
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2.0
38
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0
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14
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30
2.1
32
88
5
96
62
17
1
18
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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0
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4
1.14
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26
3.1
26
79
15
85
59
4
4
30
1.40
12047560--12047843
50
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49
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13
145
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5
29
1.46
12047627--12047795
74
2.3
73
80
11
170
59
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4
28
1.43
12047747--12047827
26
3.2
25
75
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2
6
34
1.37
12047625--12047867
24
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26
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5
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62
2
12
1.42
12049728--12049812
15
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12
68
22
62
2
12
1.42
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15
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15
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0
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10
1.44
12049737--12049795
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2.0
30
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10
1.44
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16
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0
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0.90
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0
0
44
0.99
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18
2.7
18
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64
54
2
0
44
1.11
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15
3.9
14
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26
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10
1.38
12052712--12052768
30
2.0
28
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87
26
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10
1.38
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26
7.2
26
89
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286
33
4
24
37
1.77
12059209--12059315
26
4.2
25
93
4
180
33
4
24
37
1.76
12066895--12066927
15
2.2
15
89
10
50
45
0
12
42
1.41
12066998--12067023
12
2.2
12
100
0
52
57
11
0
30
1.34
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53
74
0
0
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20
2.4
21
79
3
55
57
2
8
32
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12075450--12075515
25
2.6
25
76
17
66
53
7
4
34
1.50
12075491--12075589
48
2.0
51
80
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116
54
4
7
34
1.46
12075876--12075937
24
2.6
24
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10
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54
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6
35
1.42
12076749--12076813
2
32.0
2
87
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0
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14
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14
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10
68
43
27
1
27
1.66
12079266--12079332
28
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28
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118
41
28
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1.74
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21
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2.1
15
100
0
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25
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0
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1.14
12083971--12084038
15
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15
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10
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0
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1.13
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0
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1.54
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1.55
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1.87
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3.1
23
79
18
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22
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2.3
51
95
0
207
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16
24
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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20
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91
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2
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14
25
20
1.90
12121189--12121447
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46
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13
25
20
1.88
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35
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1
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10
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1.89
12123198--12123363
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24
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0
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24
44
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.92
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1.9
22
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19
29
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9
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12224181--12224308
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109
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1.87
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1.98
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1.98
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1.98
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2
30
15
1.57

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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