Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  434  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125660480--125660515
16
2.3
16
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66
27
0
5
1.13
125660475--125660516
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125661120--125661174
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0
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10
31
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2.4
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33
23
10
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1.9
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0
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0
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8
0
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0
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9
0
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28
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16
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14
3.2
14
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3
63
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2
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0
0.59
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2.4
27
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0
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4
10
0
0.76
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5
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84
4
10
0
0.76
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217
7.4
217
95
1
2725
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15
16
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125685460--125687045
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11.0
144
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1
2671
32
15
16
34
1.91
125685460--125687045
72
22.0
72
93
1
2671
32
15
16
34
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125687072--125687215
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2.7
54
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1
236
31
14
18
35
1.91
125687173--125687393
89
2.5
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83
6
286
30
14
19
35
1.92
125687324--125687353
13
2.3
13
94
0
51
16
6
6
70
1.31
125687072--125687728
339
1.9
337
93
0
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29
15
18
36
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125687337--125687554
54
4.0
54
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1
348
29
14
17
38
1.89
125688136--125688183
25
1.9
25
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0
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29
31
10
29
1.90
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14
5.5
14
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12
101
57
18
8
15
1.63
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17
3.1
17
91
5
79
52
23
11
11
1.70
125688586--125688669
15
5.5
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80
12
100
58
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15
1.61
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2.1
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16
0
34
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28
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53
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3.2
12
88
0
60
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0
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60
25
0
2
72
0.96
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19
2.2
19
83
8
50
21
0
4
73
1.01
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41
0
0
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56
0
0
43
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22
2.4
22
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1
12
9
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16
2.7
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79
13
50
39
2
9
48
1.48
125711983--125712019
2
19.0
2
94
5
67
48
0
0
51
1.00
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18
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3
0
55
1.17
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4
16.0
4
93
0
110
48
25
3
23
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125713701--125713739
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20
25
20
33
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125715658--125715698
20
2.0
20
100
0
82
46
14
9
29
1.77
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2.5
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38
13
17
1.89
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21
3.2
21
89
0
64
23
25
35
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1.95
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21
2.3
21
88
0
69
16
29
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1.93
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8
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70
0
29
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0.87
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20
2.7
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13
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11
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18
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14
32
1.85
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0
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0
0
50
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10
10
0
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0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
100
0.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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T
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23
11
32
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
223
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1.96
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1.96
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2.2
23
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66
38
18
6
36
1.76

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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