Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  116  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
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2.5
25
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26
21
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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24
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1
501
36
25
17
20
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29744574--29744861
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1.95
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1.97
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1.94
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25
8.9
25
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14
114
56
4
5
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1.43
29783868--29783906
16
2.4
16
86
0
51
43
28
5
23
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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5
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16
0
16
1.24
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90
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10
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28
1.93
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73
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16
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13
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68
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1.34
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100
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101
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1.93
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1.46
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0
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0
100
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0
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46
4.5
45
74
11
136
24
28
17
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1
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22
18
1.97
29830525--29830732
114
1.8
116
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33
25
22
18
1.97
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1.9
80
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2
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22
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24
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1.99
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1.99
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19
1.98
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76
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1.87
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1
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30
27
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1.87
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20
29
22
1.98
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40
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0
175
24
27
21
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29892490--29892641
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1.96
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27
16
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1.97
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1
220
22
27
24
26
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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