Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  49  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11756984--11757184
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2.4
80
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1.98
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1.9
68
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3
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22
22
23
30
1.99
11757426--11757729
44
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44
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6
211
30
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20
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1.98
11757402--11757736
133
2.5
133
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363
31
20
20
27
1.98
11757464--11757693
89
2.6
89
82
6
243
30
20
22
26
1.98
11766070--11766116
20
2.3
21
74
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61
4
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2.5
19
100
0
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2.3
23
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14
100
0
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2.0
28
100
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2.1
49
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19
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1
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1.11
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19
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0
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17
1.11
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1.9
27
88
0
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46
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1.77
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27
97
2
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4
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0
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0
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2.0
21
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57
58
9
9
21
1.59
11807008--11807068
23
2.6
23
77
12
61
67
3
1
27
1.16
11807016--11807068
25
2.3
22
80
9
52
69
3
1
24
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11807117--11807188
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21
64
56
0
4
38
1.18
11807234--11807307
17
4.5
15
70
21
51
60
2
1
35
1.19
11807216--11807351
55
2.5
54
79
9
150
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2
1
33
1.16
11807228--11807346
42
2.9
42
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102
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2
1
32
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3.3
83
83
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328
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20
18
33
1.96
11808950--11809185
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2.0
120
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2
377
30
19
15
34
1.93
11817106--11817145
19
2.1
19
86
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55
42
5
20
32
1.73
11819353--11819426
34
2.1
35
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2
141
45
12
9
32
1.73
11820522--11820562
21
2.0
21
85
9
57
58
9
9
21
1.59
11821119--11821168
21
2.3
22
83
16
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70
8
0
22
1.13
11821121--11821165
22
2.0
22
87
12
65
71
6
0
22
1.09
11821130--11821187
24
2.5
24
83
8
68
70
3
1
24
1.12
11821341--11821416
18
4.2
18
79
15
77
59
2
0
38
1.12
11823630--11823688
31
1.9
31
92
0
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20
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1.81
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1
48
1.41
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22
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11
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36
18
20
23
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3.2
26
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25
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27
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139
17
24
22
36
1.95
11849579--11849691
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2.1
54
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165
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22
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1.94
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19
2.0
22
85
14
59
17
2
47
32
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11852552--11852633
35
2.3
35
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15
80
2
24
3
69
1.17
11855022--11855085
21
3.3
20
72
16
71
43
0
3
53
1.16
11855009--11855085
38
2.1
37
80
7
84
44
0
5
50
1.24
11855018--11855093
17
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1
2
55
1.22
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100
0
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6
10
16
1.41
11860376--11860414
20
2.0
20
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10
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0
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1.00
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29
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30
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11865958--11866045
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40
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110
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22
0.92
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0
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15
2.0
15
93
0
51
40
10
0
50
1.36
11884072--11884126
26
2.1
26
100
0
110
30
14
27
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11885766--11886015
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2.7
94
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3
335
24
14
13
48
1.79
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19
2.3
19
88
12
61
73
2
7
16
1.15
11886200--11886241
18
2.3
19
87
4
59
73
2
7
16
1.15
11888289--11888317
3
9.7
3
100
0
58
34
31
0
34
1.58
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2.0
17
100
0
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5
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24
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4
20
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1.71
11903865--11904100
3
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15
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2
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3
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2.0
27
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5.2
26
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1.78
11919325--11919458
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2
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1.78
11923546--11923585
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1.9
21
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20
12
17
1.78
11923597--11923649
26
2.0
26
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7
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24
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20
39
1.91
11925134--11925217
26
3.2
26
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0
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34
25
7
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1.83
11928010--11928123
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5.1
22
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20
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0
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2.0
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17
0
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11928093--11928126
16
2.2
16
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11
0
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1.38
11928042--11928117
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2.5
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15
0
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11928139--11928202
26
2.5
26
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0
119
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1
15
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0
0
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0.98
11928332--11928720
126
3.1
126
84
1
469
36
16
16
30
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11931803--11931900
27
3.6
27
70
22
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4
4
34
1.37
11931786--11931918
56
2.4
56
94
0
230
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3
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1.42
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18
1.9
18
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0
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2
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28
1.71
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7
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7
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0
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2
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1.40
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11934242--11934306
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22
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22
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30
1.98
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2.0
24
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0
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22
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22
25
1.99
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17
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0
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19
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19
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7
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0
0
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1.98
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22
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18
1.96
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26
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2
227
35
24
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1.78
11982083--11982216
51
2.6
52
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2
227
35
24
5
34
1.78
11982212--11982243
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3.2
10
100
0
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9
50
1.66
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26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11987034--11987143
26
4.2
26
97
0
184
36
24
5
33
1.79
11993731--11993863
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5.2
25
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4
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4
25
36
1.76
11995341--11995393
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2.0
26
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22
15
24
1.92
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218
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5
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1.78
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25
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20
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24
1.92
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1.81
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17
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1.81
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38
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30
1.89
12004856--12005016
38
4.2
38
84
4
198
32
24
21
21
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444