Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr10 129486693 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  252  of  444  ( 53255 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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29
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3.9
39
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24
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12
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0
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3.5
28
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29
13
26
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.5
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114
29
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23
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1.91
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17
23
1.92
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22
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19
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1.94
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250
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2.1
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18
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36
1.95
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27
2.4
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20
19
19
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2.9
22
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23
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1.99
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86
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19
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13
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29
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29
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1.94
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223
20
23
18
37
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72008044--72008250
53
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26
25
21
27
1.99
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1.9
120
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25
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0
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1.9
40
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0
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7
34
23
34
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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24
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30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
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20
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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220
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24
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3
201
29
20
19
30
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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