Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  2  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
388447--388527
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0
0
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1.00
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0
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2.0
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6
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2.0
17
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0
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0
0
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30
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0
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20
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64
0
5
30
1.15
436559--436990
22
18.6
22
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22
117
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1
12
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1.40
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172
62
0
9
27
1.33
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1.9
123
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1
11
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26
14.4
23
68
26
170
61
1
11
26
1.38
436615--436886
49
5.8
47
80
10
279
61
1
11
26
1.38
436531--436808
120
2.3
119
86
10
370
61
1
10
26
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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30
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5
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5
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139
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1
17
24
1.49
436874--437116
11
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10
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18
139
56
1
17
24
1.49
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18
2.8
16
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17
62
67
0
14
18
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17
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1
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20
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20
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0
10
29
1.30
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16
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5
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2.1
18
89
0
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18
2.2
19
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4
55
65
0
2
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1.06
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19.3
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0
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22
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0
1
15
0.75
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4.8
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20
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1
16
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7
77
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54
82
0
1
15
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2.4
25
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10
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0
3
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1.9
19
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0
2
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1.9
24
83
8
60
62
4
0
33
1.14
471620--471663
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2.2
20
84
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54
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6
0
22
1.11
473328--473480
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1.9
81
86
2
218
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23
17
1.93
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12
2.2
12
100
0
52
15
0
7
76
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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9
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20
0
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70
1.13
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1.9
45
85
2
118
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10
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2.0
32
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0
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2.6
16
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50
28
2
0
69
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25.0
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10
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4
1
62
1.22
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1.9
21
89
5
62
30
2
5
61
1.31
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2.2
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135
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6
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2
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3
5
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1.39
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23
2.6
23
83
0
73
35
3
5
55
1.38
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2.6
24
80
11
67
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6
4
50
1.49
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3.5
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1.66
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4.6
35
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192
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10
31
1.89
510253--510424
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217
34
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0
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1.9
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0
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2.0
18
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0
63
16
36
27
19
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
547647--547810
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1.9
85
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37
9
3
48
1.54
547832--547856
6
4.2
6
100
0
50
84
0
0
16
0.63
555799--555970
93
1.8
93
93
0
299
27
29
21
21
1.99
555800--555967
46
3.6
46
79
10
189
27
29
21
21
1.99
557357--557399
17
2.4
18
80
7
61
53
0
4
41
1.21
565579--565619
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
574496--574526
16
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16
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0
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1.64
577941--578008
21
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21
63
29
54
36
19
13
30
1.90
579913--579940
6
4.7
6
100
0
56
82
0
0
17
0.68
580933--581040
54
2.0
54
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584934--584958
2
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2
100
0
50
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0
48
0
1.00
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14
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0
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0
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1.19
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30
2.1
30
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47
11
4
36
1.60
596076--596119
23
1.9
23
81
9
54
52
0
2
45
1.13
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24
2.4
24
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28
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0
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1.13
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4.8
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14
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4
33
1.30
600767--600883
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23
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20
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0
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1.10
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18
2.2
20
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12
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61
0
2
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1.09
601153--601196
21
2.1
21
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8
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0
2
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1.09
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16
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0
56
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0
50
0
1.00
602177--602234
22
2.6
22
86
0
80
13
6
53
25
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
2.8
28
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0
138
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7
3
24
1.37
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12
3.2
12
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3
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2
2
23
1.10
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38
2.0
38
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0
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18
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1.9
80
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11
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2
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37
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0
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0
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0
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20.0
2
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0
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0
0
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21
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0
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21
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0
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0
0
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2.5
18
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23
51
63
0
0
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22
2.0
23
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14
3.1
14
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45
9
2
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1.48
647578--647633
6
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14
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23
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2.2
34
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7
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1.71
651313--651445
69
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35
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10
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655280--655310
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2.0
16
93
6
55
38
0
0
61
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
657055--657125
31
2.2
32
83
11
85
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7
8
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1.60
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6
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0
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0
0
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0
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1.75
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2
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0
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0
0
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2.4
28
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0
127
27
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1.60
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3.8
36
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7
139
40
8
23
27
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444