Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  344  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99610808--99610846
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2
0
15
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1
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2
4
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3
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0
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17
2.4
17
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0
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2
0
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1.10
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14
62
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0
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58
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3
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2.4
25
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28
1
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1.23
99612117--99612200
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2.4
35
76
7
82
30
2
3
63
1.24
99612249--99612331
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3.6
23
75
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64
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4
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62
39
4
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25
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2.7
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26
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2.0
20
85
15
53
36
0
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2.9
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20
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42
2.2
43
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1
127
31
23
18
26
1.97
99651009--99651116
43
2.5
44
82
5
132
32
22
19
25
1.97
99654325--99654491
40
4.2
40
81
2
176
24
27
22
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
22
25
2.00
99662332--99662498
40
4.2
40
81
2
176
24
27
22
25
2.00
99662348--99662498
80
1.9
79
83
6
198
23
27
22
25
2.00
99666309--99666402
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21
1.94
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18
1.9
18
94
0
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45
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1.79
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2.0
40
100
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5
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18
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16
74
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3
29
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2
17.5
2
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0
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2
0
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1.29
99708133--99708183
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13
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85
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11
333
35
18
16
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99709320--99709619
87
3.4
87
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12
348
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18
16
29
1.93
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2.0
103
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2
325
39
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16
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1.62
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48
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1.81
99720011--99720893
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1509
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1.94
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71
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0
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35
17
28
18
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.93
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0
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18
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29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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21
28
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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80
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1.98
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1.98
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29
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2.0
30
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0
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31
22
8
37
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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