Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  421  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121912045--121912181
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17
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2.0
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11
18
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121914671--121914711
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0
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0
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0
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0
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20.0
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1
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4.3
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19
64
33
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2
58
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121916965--121917056
3
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2.5
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3.5
142
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3
752
27
16
19
35
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1.9
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0
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20.0
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1.34
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3
31.3
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69
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50
29
4
4
61
1.34
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2.4
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27
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0
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2.1
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40
7
4
47
1.52
121939576--121939629
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3.3
16
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21
58
40
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1
48
1.46
121943111--121943174
25
2.6
24
85
2
83
17
25
21
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121943120--121943174
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2.2
25
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18
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2
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0
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10
48
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121961973--121962001
2
14.5
2
100
0
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0
0
48
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2.8
28
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28
23
2
46
1.65
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10
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5
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2
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84
16
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0
17
0
0.68
121975349--121975387
15
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82
0
17
0
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82
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19
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3.0
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83
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1.91
121977201--121977316
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2.0
58
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1.97
121977259--121978841
78
19.9
76
72
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946
28
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20
34
1.95
121977533--121977714
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2.1
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244
27
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17
38
1.91
121977642--121977861
71
3.1
71
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1
350
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20
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14
2.5
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20
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18
37
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26
17
18
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1.93
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17
17
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1.55
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1.97
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19
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1.94
121978821--121978870
14
3.6
14
80
0
55
22
12
6
60
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
5
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54
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723
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15
17
37
1.91
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164
3.0
164
90
6
756
28
15
17
37
1.91
121978955--121979449
110
4.5
108
89
7
723
28
15
17
37
1.91
121979700--121979729
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0
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0
0
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19
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34
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27
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2.1
19
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4
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23
0
46
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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15
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6
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0
6
0.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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122078087--122078128
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1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
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17
30
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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