Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  301  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86793632--86793772
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1.9
73
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1
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0
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2.0
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0
183
31
15
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1.93
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14
1.9
14
100
0
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14
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86793868--86794102
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19
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86794004--86794320
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18
17
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23
25
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86806436--86806500
25
2.7
23
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25
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1.64
86806512--86806667
59
2.6
60
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2
287
25
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21
1.64
86807237--86807304
10
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2
0
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1.12
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2
0
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1.14
86807235--86807301
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17
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20
59
38
2
0
58
1.14
86807158--86807304
48
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1.32
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2.5
24
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25
2.0
25
91
0
80
34
8
6
51
1.57
86807546--86807593
16
3.1
15
90
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69
31
2
2
64
1.16
86807546--86807597
8
6.5
8
82
8
61
30
1
1
65
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86809051--86809152
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15
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25
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1
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1.31
86809294--86809342
3
16.3
3
80
0
53
34
6
2
57
1.35
86809294--86809342
15
3.3
15
82
0
62
34
6
2
57
1.35
86812660--86812763
29
3.6
29
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3
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26
26
16
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1.97
86823870--86824853
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21
28
1.97
86823868--86824132
92
2.9
90
76
6
286
31
19
22
26
1.98
86823870--86824671
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8.9
91
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15
280
31
18
21
28
1.97
86823871--86824353
226
2.2
223
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4
634
30
19
22
27
1.98
86823871--86824488
226
2.7
225
81
4
590
30
18
22
28
1.97
86824364--86824857
229
2.2
225
79
6
498
33
17
20
28
1.95
86825447--86825496
21
2.4
21
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3
93
70
8
8
14
1.34
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30
1.9
30
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0
89
20
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1.88
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25
2.4
25
80
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23
26
13
36
1.92
86832404--86832500
40
2.5
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12
106
39
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10
16
1.83
86833476--86833536
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2.1
29
93
0
104
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18
18
1.66
86833481--86833544
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29
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1.59
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3
3
60
1.32
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24
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60
60
4
2
32
1.28
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2.3
40
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116
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1.9
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61
17
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2
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1.04
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1.43
86849463--86849520
23
2.4
24
77
8
64
56
3
3
36
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86849522--86849594
19
3.7
19
75
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2
34
1.40
86849523--86849572
21
2.5
21
87
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68
58
8
4
30
1.45
86852651--86852792
60
2.3
60
79
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153
28
21
18
32
1.96
86857598--86857731
12
11.2
12
65
23
59
22
4
2
70
1.16
86857596--86857635
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0
0
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0.81
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2.3
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11
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1.06
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1.86
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1.92
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29
3.7
28
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18
72
28
3
1
65
1.21
86888657--86888714
26
2.2
27
82
14
77
29
8
0
62
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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40
2
2
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17
2.0
17
100
0
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17
5
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47
1.71
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6
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1.80
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30
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30
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11
208
48
13
16
21
1.80
86890556--86890742
85
2.2
85
91
0
302
48
13
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21
1.80
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2.5
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22
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1.93
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19
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1.9
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0
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1.94
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0
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0
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27
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1.99
86911519--86911694
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27
21
22
1.99
86911570--86911713
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29
28
20
22
1.98
86918623--86918690
12
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11
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1
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20
1.14
86918622--86918690
29
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28
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72
1
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1.13
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3
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3
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5
103
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2
1
31
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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26
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72
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0
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0
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0
1
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1.01
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0
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0
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100
0
54
14
0
40
44
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86968110--86968143
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9
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5
20
0
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1.04
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0
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0
0
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25
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50
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0
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49
1.11
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2.1
28
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0
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22
16
5
55
1.60

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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