Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  3  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
101
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2.0
16
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0
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45
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34
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0
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20
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21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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11
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2.1
44
100
0
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24
25
1.85
755481--755567
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2.6
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0
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5
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765188--765263
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2.5
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0
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1
21
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2.2
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0
98
21
3
19
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18
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17
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2
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1.9
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68
5
0
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1.12
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1.9
17
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50
29
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5
50
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3.2
31
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2.6
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133
31
33
9
25
1.89
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34
1.9
34
84
6
87
43
6
1
49
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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12
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30
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2.7
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261
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23
14
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0
45
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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9
4.1
9
92
0
65
32
48
0
18
1.49
863786--863825
22
1.9
21
90
10
64
50
7
15
27
1.70
867599--867640
13
3.1
14
90
6
61
40
19
7
33
1.78
868520--868569
21
2.4
21
93
0
82
46
2
6
46
1.39
868740--868805
30
2.2
30
97
2
123
39
24
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28
1.82
874555--874762
104
2.0
104
97
0
389
39
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12
37
1.77
878947--879014
31
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29
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18
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23
14
11
50
1.76
880115--880266
31
4.8
31
74
11
123
38
11
5
44
1.66
888378--888450
28
2.5
28
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8
0
35
1.29
890714--891058
52
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52
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432
28
14
6
49
1.69
890714--891058
105
3.3
102
83
7
423
28
14
6
49
1.69
891649--891678
4
7.5
4
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0
51
50
20
0
30
1.49
895903--895945
6
6.7
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15
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2
2
20
1.04
895903--895942
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2.0
21
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1.04
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0
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0
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3
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1.01
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15
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4
1
40
1.29
918745--918849
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3.4
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1
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1.31
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13
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0
50
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0
48
1.40
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18
2.2
18
85
4
51
36
0
2
60
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
107
85
9
336
27
12
21
38
1.90
942481--942841
197
1.9
195
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19
17
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1.94
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2.4
26
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10
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26
0
3
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141
2.0
143
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420
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15
11
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24
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964688--964751
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30
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1.62
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1.9
25
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0
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17
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23
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20
1.94
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20
2.3
19
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15
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11
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1.61
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0
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0
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0
0
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0
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0
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2.1
35
100
0
146
36
15
16
31
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1017457--1017805
173
2.0
173
98
1
673
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29
1.89
1019537--1019644
44
2.4
44
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3
144
29
23
13
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1.93
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19
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8
0
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5
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0
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0
0
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0
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48
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14
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0
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22
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0
0
59
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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