Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  141  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37687054--37687131
15
5.2
15
78
9
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1.8
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21
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28
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1.98
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4.2
40
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2.00
37691764--37691914
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1.9
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198
23
27
22
26
2.00
37694164--37694225
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2.1
30
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1
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33
1.67
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4.7
40
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252
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1.99
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4.7
40
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2
270
26
29
21
22
1.99
37704044--37704250
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2.6
79
87
4
301
27
28
20
22
1.99
37711178--37711328
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3.8
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2
142
23
27
22
25
2.00
37711178--37711328
80
1.9
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198
23
27
22
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2.0
29
100
0
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20
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27
2.6
27
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2
131
31
27
12
28
1.93
37718717--37718862
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3.7
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26
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23
1.99
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24
7.0
24
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10
217
24
20
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1.91
37732697--37732884
76
2.5
77
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242
24
21
14
38
1.92
37732709--37732886
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245
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2.0
33
100
0
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11
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1.74
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4.0
43
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14
156
35
26
15
22
1.94
37748981--37749142
85
1.9
86
82
8
206
35
25
16
22
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37750558--37750678
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2.9
41
82
4
152
28
24
15
30
1.96
37758120--37758229
43
2.6
42
82
5
132
28
26
16
29
1.97
37759040--37759082
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2.1
21
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4
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20
16
0
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1.32
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18
2.9
18
80
0
61
49
15
16
18
1.80
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27
6.0
27
85
0
198
40
19
14
25
1.90
37762526--37762710
3
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2.8
17
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12
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2.0
22
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28
16
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1.56
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12
2.1
12
100
0
50
16
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1.70
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48
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4
506
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6
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1.82
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0
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1.98
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29
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40
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0
364
26
27
21
23
1.99
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3.3
25
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16
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1.79
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49
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49
93
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692
29
30
8
32
1.87
37777995--37778434
96
4.6
96
92
3
689
29
30
8
32
1.87
37777995--37778434
145
3.1
145
94
2
752
29
30
8
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1.87
37784032--37784309
39
6.8
40
82
11
323
25
28
21
23
1.99
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567
29
29
8
32
1.86
37785714--37786097
140
2.8
140
89
8
565
29
29
8
32
1.86
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25
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25
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34
1.79
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9.3
49
94
2
710
29
29
7
32
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37791688--37791955
39
6.8
40
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355
26
27
21
23
1.99
37791688--37791954
79
3.4
78
85
3
356
26
28
21
23
1.99
37791688--37791955
118
2.3
119
86
3
371
26
27
21
23
1.99
37793408--37793486
25
3.3
25
66
16
76
31
29
5
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1.79
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49
9.3
49
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1
746
29
30
8
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2.1
17
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0
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1.69
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108
29
16
24
29
1.97
37834153--37835589
177
8.1
177
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2
1994
29
17
25
27
1.97
37834767--37835397
44
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46
67
14
217
29
18
25
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
129
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2
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40
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2.00
37845227--37845410
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2.3
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2.00
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0
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0
0
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1.00
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2.00
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2.00
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2.00
37856843--37857026
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2.00
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1.96
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1.95
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2.1
34
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2
0
40
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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121
24
19
25
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37987453--37987607
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1.99
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22
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24
10
35
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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