Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  230  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64919062--64919118
23
2.5
23
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2
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17
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2.1
104
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0
308
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1.95
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2.1
36
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0
123
28
21
14
36
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140
2.0
140
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398
30
22
13
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1.93
64925016--64925050
18
1.9
18
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22
14
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20
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24
1.99
64935036--64935184
80
1.9
80
82
2
192
22
30
24
22
1.99
64935077--64935184
40
2.7
38
85
8
128
20
29
25
24
1.99
64939350--64939387
18
2.0
20
90
10
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2
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57
1.41
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18
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0
5
63
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12
128
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2.7
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0
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34
1.68
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39
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129
44
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35
1.68
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2.6
22
77
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25
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0
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2
199
24
16
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30
1.97
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2.7
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32
14
21
31
1.93
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32
2.0
32
100
0
130
30
6
24
38
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
26
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7
81
35
22
15
26
1.93
64976975--64977008
10
3.4
10
91
0
50
41
2
8
47
1.50
64982102--64982152
22
2.3
22
100
0
102
41
13
27
17
1.87
64982146--64982241
28
3.5
28
73
8
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40
19
23
15
1.90
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15
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15
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3
70
62
0
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25
1.29
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21
2.0
20
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42
5
25
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1.75
64986185--64986297
23
5.0
23
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142
22
19
19
38
1.93
64986469--64986508
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2.2
19
86
4
55
47
0
22
30
1.52
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20
2.5
20
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10
64
27
6
0
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15
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21
4
0
74
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0
13
0
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80
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2
183
22
30
24
22
1.99
64998833--64998940
40
2.7
38
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128
21
29
25
23
1.99
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1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
65006951--65007058
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
65013623--65013657
17
2.1
17
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20
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11
34
1.88
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4.2
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4
140
23
27
23
26
2.00
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4.4
47
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0
302
28
29
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32
1.88
65017789--65017972
48
3.8
48
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1
332
34
27
6
32
1.82
65017640--65017966
94
3.4
97
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340
30
28
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32
1.87
65021602--65021753
40
3.8
39
85
7
130
25
26
21
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65021621--65021806
40
4.7
40
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218
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26
21
25
2.00
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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43
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12
182
28
29
17
25
1.97
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1.9
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217
28
30
17
23
1.97
65035786--65035993
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54
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1
211
20
23
17
38
1.93
65035804--65035993
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3.5
54
77
5
213
19
23
18
38
1.93
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2.3
22
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3
59
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25
9
32
1.88
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2.3
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26
28
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28
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4.1
40
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27
21
25
2.00
65043912--65044075
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2.0
80
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25
27
21
25
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96
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15
23
37
1.93
65084050--65084213
40
4.1
40
80
6
188
25
21
28
25
1.99
65092692--65092822
30
4.5
30
86
8
171
32
13
25
28
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65092692--65092822
58
2.2
58
86
4
174
32
13
25
28
1.94
65100209--65100340
30
4.5
31
87
7
168
31
13
25
28
1.94
65100209--65100340
59
2.2
59
85
5
169
31
13
25
28
1.94
65102084--65102245
40
4.1
40
78
6
175
25
21
27
25
1.99
65108916--65109002
24
3.6
24
96
0
165
21
17
25
35
1.95
65108916--65109024
48
2.3
48
91
3
175
24
17
23
33
1.96
65108916--65109024
24
4.5
24
90
2
157
24
17
23
33
1.96
65111663--65111750
26
3.4
26
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0
149
27
22
20
29
1.99
65111800--65111874
20
3.8
20
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18
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1.83
65111800--65111855
11
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11
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16
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32
19
10
37
1.86
65111817--65111873
9
5.8
10
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1.83
65118599--65118656
27
2.1
28
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50
1
18
29
1.57
65119189--65119277
24
3.8
24
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10
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21
21
20
37
1.95
65119189--65119253
22
2.8
24
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20
21
21
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1.95
65121857--65121897
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1.9
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5
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26
46
0
26
1.53
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50
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32
25
17
25
1.97
65131306--65131597
101
2.9
100
80
4
327
31
25
17
25
1.97
65131512--65131596
26
3.3
26
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18
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36
25
12
24
1.92
65131296--65131593
151
2.0
151
85
4
411
31
25
17
25
1.97
65137130--65137332
40
5.1
40
87
3
277
22
23
29
24
1.99
65143318--65143346
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0
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0
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1.00
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2.1
33
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2
109
49
8
19
22
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65152571--65152658
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17
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3
2
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9
2.9
9
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0
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0
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1.53
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17
22
28
1.97
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7
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1.96
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22
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0
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20
1.95
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1.98
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1.8
93
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0
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1.98
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1.93
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1.99
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1.84
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182
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22
28
1.84
65173864--65174278
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7.8
54
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6
474
40
9
21
28
1.84
65173865--65174278
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5.2
80
80
8
486
40
9
21
28
1.84
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17
25
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1.97
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31
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1.92
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33
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1.97
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1.96
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4.1
40
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20
28
25
1.99
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30
25
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1.93
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38
4.8
38
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5
212
29
23
22
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65190918--65191055
38
3.7
38
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1
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29
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23
25
1.99
65198121--65198162
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2.5
17
92
0
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7
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35
1.79
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2.1
27
100
0
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1.68
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1.97
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27
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23
21
34
1.97
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26
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1.84
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1.96
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1.97
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1.42
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3.3
22
64
28
60
38
15
11
34
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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