Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  112  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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25
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44
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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1.94
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114
28
13
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1.95
28378759--28378830
29
2.5
28
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13
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1.94
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58
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1.94
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20
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20
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1.98
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32
30
22
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28420675--28420721
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0
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20
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26
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31
2.1
31
100
0
128
31
6
23
39
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28511163--28511681
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49
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1
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27
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2.1
13
100
0
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1.98
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1.98
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40
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19
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20
1.9
20
88
0
58
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10
2
34
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5.0
25
71
10
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36
4
2
57
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28621173--28621231
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3
0
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1.59
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25
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0
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12
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0
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2.4
176
93
2
716
26
17
21
34
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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