Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  110  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27672471--27672583
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2.1
54
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5
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21
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1.94
27674010--27674069
24
2.5
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38
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1.67
27682881--27682994
29
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13
97
28
14
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25
1.94
27682881--27683020
28
4.9
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16
2.4
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0
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53
20
15
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1.70
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29
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70
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27
12
32
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18
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5
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1.07
27696345--27696381
17
2.3
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5
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2.0
32
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0
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69
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19
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27710080--27710677
206
2.9
207
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903
26
11
19
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1.85
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5.5
6
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0
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15
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57
1.38
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2
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1.95
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40
3.3
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25
28
23
1.99
27763779--27763908
40
3.3
39
83
4
163
23
25
28
23
1.99
27768741--27768900
20
8.0
20
80
2
187
14
23
25
37
1.92
27770987--27771160
48
3.6
48
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3
172
20
27
22
29
1.98
27770981--27771162
96
1.9
96
85
4
251
21
26
22
29
1.99
27791701--27791867
40
4.2
40
81
2
176
24
27
22
25
2.00
27791717--27791867
80
1.9
79
83
6
198
23
27
22
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27799726--27799876
40
3.8
39
82
2
142
23
27
22
25
2.00
27799726--27799876
80
1.9
79
83
6
198
23
27
22
25
2.00
27804323--27804359
18
2.0
19
89
5
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21
35
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5
100
0
118
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0
0
59
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19
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58
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1.19
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24
2.0
24
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0
0
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22
16
1.93
27814750--27814861
54
2.1
54
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3
154
38
23
22
16
1.93
27822486--27822595
27
4.2
26
83
12
134
37
23
22
16
1.94
27822486--27822595
52
2.1
54
88
6
163
37
23
22
16
1.94
27824011--27824061
24
2.1
24
92
0
84
23
39
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35
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19
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20
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4
61
74
0
6
18
1.04
27829674--27829763
26
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79
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71
0
5
23
1.07
27829672--27829744
8
8.6
8
74
18
51
72
0
5
21
1.04
27829693--27829763
8
8.5
8
72
27
51
70
0
5
23
1.08
27830194--27830359
9
17.6
9
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2
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1.25
27830194--27830401
30
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28
72
16
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36
2
2
59
1.24
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13
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14
88
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40
0
0
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1
0
51
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1.81
27841341--27841393
10
5.3
10
73
8
54
20
9
1
67
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27842708--27842885
46
3.8
46
77
11
186
21
20
28
29
1.98
27842710--27842880
93
1.8
93
89
2
272
21
20
28
29
1.98
27843110--27843147
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
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0.91
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21
3.9
21
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21
2
0
75
0.91
27853250--27853297
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8
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22
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0
75
0.91
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2.3
22
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60
4
4
32
1.34
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49
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3
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2.3
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1.14
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3
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21
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23
23
1.88
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92
1.8
94
87
5
256
28
18
28
23
1.98
27865402--27865573
92
1.9
94
82
7
226
28
19
29
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27876160--27876367
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5.2
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6
224
25
27
21
25
1.99
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15
2.0
15
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6
51
0
17
0
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0.66
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47
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5
257
30
18
27
23
1.97
27885204--27885522
93
3.4
92
82
6
320
30
18
27
22
1.97
27885204--27885527
47
6.8
48
78
9
186
30
19
28
22
1.98
27885205--27885525
46
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47
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235
30
19
28
22
1.98
27887282--27887391
50
2.2
52
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143
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3
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24
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28
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0
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2
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0
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17
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1.93
27902902--27902961
21
2.9
21
82
2
77
35
15
15
35
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.93
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3.8
44
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1.95
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0
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0
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0
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52
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4.2
125
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3.9
39
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0
234
24
20
31
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27987701--27987883
39
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24
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0
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0
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11
176
24
29
19
26
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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