Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  300  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86653804--86653862
31
1.9
31
89
0
91
55
22
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13
1.64
86654108--86654148
21
2.0
21
85
0
55
4
51
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29
1.63
86654569--86654597
13
2.1
14
93
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51
55
10
0
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1.34
86659641--86659754
9
13.0
9
71
18
89
33
1
16
48
1.57
86659691--86659854
30
5.3
30
71
13
98
37
3
12
46
1.58
86659645--86659754
16
6.9
16
79
8
116
32
1
16
49
1.56
86659773--86660228
9
52.8
9
65
22
98
37
3
13
44
1.61
86659868--86659934
29
2.3
30
92
2
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40
4
10
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1.59
86659948--86660015
30
2.3
30
92
0
109
38
4
11
45
1.61
86659675--86659825
51
3.1
51
90
7
249
35
2
13
48
1.56
86659740--86660076
80
4.2
81
98
0
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37
3
13
45
1.60
86659980--86660138
46
3.3
46
80
6
167
37
4
13
44
1.64
86660108--86660220
16
7.1
16
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11
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38
3
15
43
1.63
86660062--86660212
80
1.9
78
87
5
223
37
3
15
43
1.63
86660266--86660301
17
2.1
17
100
0
72
36
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5
52
1.48
86661747--86661775
14
2.1
14
100
0
58
31
13
0
55
1.39
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2.9
37
79
0
128
25
11
46
16
1.80
86664803--86664834
15
2.1
15
94
0
55
28
6
0
65
1.16
86664896--86664944
21
2.3
21
82
0
62
42
40
2
14
1.57
86665745--86665939
105
1.9
104
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3
275
24
19
17
37
1.93
86666274--86666443
89
1.9
90
92
1
288
36
17
16
29
1.92
86666191--86666859
96
7.2
96
76
9
489
34
17
18
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86666191--86666859
45
14.5
46
70
11
352
34
17
18
29
1.94
86666729--86666875
51
3.0
50
76
7
151
36
18
18
27
1.94
86666191--86666968
96
8.4
94
75
9
363
34
17
19
29
1.94
86673942--86673977
3
12.0
3
100
0
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0
0
33
0.92
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3.2
26
96
0
150
34
4
23
36
1.76
86676466--86676579
27
4.2
26
84
7
138
17
23
21
36
1.94
86676466--86676579
54
2.1
54
86
3
158
17
23
21
36
1.94
86680111--86680446
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3.0
112
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1
471
32
31
9
25
1.89
86681321--86681794
236
2.0
236
97
0
885
36
20
16
26
1.94
86682508--86682705
43
4.6
43
94
0
333
30
32
24
12
1.92
86682495--86682730
129
1.9
128
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3
343
30
32
24
13
1.93
86682698--86682781
38
2.2
38
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0
123
35
27
16
20
1.94
86691405--86691505
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
86696423--86696471
21
2.3
22
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6
66
2
26
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71
0.97
86696429--86696490
26
2.4
25
79
12
72
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29
0
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0.98
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19
1.9
19
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0
40
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59
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14
52
0
34
0
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0.93
86698456--86698512
29
2.0
28
83
13
71
15
15
0
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2.1
16
100
0
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18
6
18
57
1.60
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2.0
253
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0
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20
12
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2.0
34
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0
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14
17
44
1.86
86731814--86732074
39
6.6
39
90
2
321
22
31
20
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86731814--86732074
117
2.2
118
86
4
357
22
31
20
25
1.98
86731845--86732085
39
6.2
39
92
2
351
23
31
19
25
1.98
86740897--86741080
40
4.6
40
78
4
147
22
24
29
23
1.99
86748992--86749175
40
4.6
40
78
4
147
22
24
29
23
1.99
86751231--86751452
39
5.6
39
89
1
293
22
31
20
24
1.98
86751231--86751452
117
1.9
119
87
1
331
22
31
20
24
1.98
86757156--86757241
24
3.6
23
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2
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1
20
0.98
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21
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1
17
0.90
86757156--86757242
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17
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2.3
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60
0
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0
2
36
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86773598--86773687
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3
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4.3
28
74
12
108
29
6
2
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1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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58
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86773589--86773676
28
3.1
28
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3
1
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86773551--86773686
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0
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0
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35
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4
253
24
16
24
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86792495--86792842
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0
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13
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0
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13
6
65
1.45

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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