Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  403  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117144814--117145145
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2.7
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1.95
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19
20
24
1.95
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3.1
51
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2
277
36
24
5
33
1.79
117162807--117162966
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2.1
77
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286
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33
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2.0
27
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15
22
37
1.92
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6.2
26
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2
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5
34
1.79
117170974--117171134
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2.1
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2.0
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1
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31
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1.97
117184496--117184762
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2.8
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11
282
25
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2.0
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30
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2.0
13
100
0
52
15
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38
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1.88
117195839--117195945
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2.0
54
100
0
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24
23
5
46
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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64
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31
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2.2
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63
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2.1
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5
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33
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31
2.5
31
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0
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26
42
13
1.87
117211572--117211655
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2.6
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15
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33
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1.09
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21
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1.9
40
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15
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2.2
22
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2
35
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100
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34
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2.2
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100
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2.0
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185
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39
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0
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0
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0
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2.1
24
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0
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29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
21
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9
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1.93
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3.1
39
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35
34
17
13
1.89
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1.9
46
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33
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7
33
1.84
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2.1
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21
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1
1
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37
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2
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15
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.96
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23
30
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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29
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20
1.98
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2.1
24
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10
59
52
12
4
32
1.57

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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