Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  84  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19819131--19819178
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2.4
21
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2
22
1.23
19822150--19822235
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2.2
40
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36
6
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47
1.63
19822310--19822359
14
3.6
14
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5
57
36
2
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1.20
19822831--19822901
32
2.2
32
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2
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18
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19822910--19822952
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2.0
21
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32
51
0
16
1.45
19822927--19822957
14
2.1
14
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5
53
38
45
0
16
1.47
19824143--19824310
41
4.1
41
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22
22
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19825789--19825842
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1
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20
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1
1
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2.0
41
100
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2.5
57
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20
2
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1.8
130
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290
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18
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19897336--19897381
24
2.0
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17
23
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19915717--19916120
202
2.0
201
97
0
754
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14
18
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1.90
19918350--19918536
94
2.0
94
98
0
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39
4
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25
2.5
26
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7
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13
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19919118--19919163
17
2.7
17
80
12
51
39
6
15
39
1.73
19919135--19919172
17
2.2
18
86
13
53
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7
15
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1.77
19922598--19922672
37
2.0
37
100
0
150
33
18
10
37
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19932924--19932990
31
2.2
31
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0
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13
5
35
1.68
19933641--19933693
3
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3
96
0
97
66
1
0
32
1.03
19933844--19933878
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2.2
16
89
0
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40
8
8
42
1.66
19935444--19935479
16
2.2
17
90
5
56
41
8
0
50
1.33
19938103--19938246
33
4.4
33
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1
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20
24
13
41
1.88
19938088--19938246
66
2.4
66
81
2
167
20
24
13
42
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19961177--19961248
6
12.2
6
94
2
128
81
0
1
16
0.75
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17
2.0
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36
15
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19964302--19964560
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5.6
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0
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22
22
13
42
1.88
19968809--19969096
49
5.8
49
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26
19
26
1.99
19968814--19969101
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2.9
100
95
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513
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26
19
26
1.99
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13
100
0
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53
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0
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1.41
19986627--19986707
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2.0
40
100
0
162
46
2
22
28
1.64
19989996--19990046
26
2.0
26
100
0
102
13
19
23
43
1.87
19993706--19993756
25
2.0
26
85
7
70
27
15
19
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1.92
19995231--19995338
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4.2
26
93
0
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15
23
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1.91
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2.3
130
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419
39
15
23
21
1.91
20005885--20005995
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4.3
26
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36
23
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33
1.82
20012013--20012072
28
2.1
28
81
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68
38
1
3
56
1.26
20012039--20012103
24
2.7
23
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30
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1
64
1.18
20012079--20012115
15
2.4
16
90
4
58
24
2
0
72
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20014418--20014457
20
2.0
21
95
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40
17
15
27
1.89
20016651--20016706
25
2.3
25
84
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69
30
3
1
64
1.21
20018516--20018562
20
2.4
20
85
3
60
12
8
27
51
1.69
20021784--20021826
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2.0
21
100
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13
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1.79
20029531--20029557
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1.9
14
100
0
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14
14
1.81
20029593--20029660
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2.0
34
100
0
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35
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8
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1.72
20031165--20031309
33
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18
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29
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0
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6
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0
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54
0
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34
1.37
20055329--20055363
12
2.9
12
91
0
61
54
0
11
34
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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50
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28
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50
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1
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22
23
19
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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1
1
24
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20134573--20134627
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6
22
34
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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