Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr10 129486693 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  431  of  444  ( 53255 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
124667498--124667548
24
2.0
25
85
14
70
64
3
0
31
1.11
124667514--124667576
28
2.3
28
78
8
67
66
1
4
26
1.20
124676746--124676812
27
2.5
28
80
9
68
50
0
1
47
1.10
124677693--124677788
49
2.0
49
82
0
120
51
4
6
38
1.47
124681250--124681305
27
2.1
27
100
0
112
60
17
7
14
1.55
124681974--124682293
131
2.5
131
81
2
378
36
19
18
25
1.94
124683300--124683366
28
2.3
29
80
10
75
56
4
4
34
1.39
124688709--124688739
16
1.9
16
93
0
53
35
6
3
54
1.42
124696532--124696715
67
2.8
64
81
8
203
23
30
16
28
1.97
124702776--124702811
12
2.9
12
91
4
54
55
0
19
25
1.43
124705296--124705360
27
2.3
28
79
12
80
29
3
7
60
1.40
124705296--124705360
28
2.3
27
82
12
78
29
3
7
60
1.40
124706544--124706578
9
3.9
9
84
0
52
25
14
20
40
1.90
124708144--124708230
21
4.0
23
80
10
92
37
25
21
14
1.92
124708603--124708659
15
3.9
15
90
2
89
50
12
0
36
1.40
124709752--124709808
5
11.4
5
96
0
105
59
1
0
38
1.08
124709831--124709867
8
4.6
8
100
0
74
62
0
0
37
0.96
124711948--124712022
30
2.5
30
81
10
82
34
2
6
56
1.40
124711994--124712049
24
2.3
25
82
14
64
30
3
8
57
1.47
124712106--124712142
19
1.9
19
94
0
65
32
13
2
51
1.55
124712211--124712246
9
4.0
9
85
0
54
38
0
2
58
1.13
124712210--124712252
20
2.0
20
86
8
59
39
0
2
58
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
124712592--124712647
25
2.3
24
79
14
62
35
17
3
42
1.67
124715688--124715745
22
2.6
22
83
2
71
46
3
1
48
1.29
124721683--124721852
66
2.6
66
75
0
169
34
17
18
30
1.93
124722610--124722637
3
9.3
3
100
0
56
67
0
0
32
0.91
124724009--124724112
52
2.0
52
92
1
174
36
10
18
34
1.85
124728639--124728765
61
2.1
61
89
4
195
39
10
4
45
1.59
124729629--124729666
13
2.9
14
84
15
62
31
0
5
63
1.17
124740931--124740979
26
2.0
24
88
8
71
63
6
0
30
1.19
124740966--124741008
21
2.0
22
81
4
52
69
9
2
18
1.26
124741965--124742171
43
4.8
42
83
3
243
27
19
28
24
1.98
124741965--124742171
86
2.4
86
87
0
288
27
19
28
24
1.98
124742246--124742312
31
2.2
31
86
0
89
61
17
2
17
1.47
124748061--124748188
9
13.6
9
76
9
121
31
0
21
46
1.57
124748061--124748188
57
2.2
57
84
0
166
31
0
21
46
1.57
124748496--124749456
372
2.6
373
98
0
1836
38
11
14
35
1.82
124749504--124749550
21
2.4
18
78
18
58
48
6
8
36
1.59
124751804--124751843
20
2.0
20
90
0
62
42
17
20
20
1.89
124753660--124753727
24
2.8
25
73
10
68
38
4
0
57
1.19
124753699--124753730
15
2.1
15
94
0
55
31
9
0
59
1.29
124754149--124754200
18
2.7
19
82
8
61
46
1
3
48
1.31
124754543--124754675
40
3.3
41
86
6
173
16
23
25
34
1.95
124754984--124755030
24
2.0
24
100
0
94
8
44
21
25
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
124757157--124757192
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
124757427--124757465
21
2.0
20
85
14
55
46
23
0
30
1.53
124758564--124758649
10
8.9
9
71
20
50
59
2
6
31
1.37
124760646--124760700
24
2.2
25
87
3
76
45
18
14
21
1.85
124764345--124764416
21
3.4
21
64
7
56
44
16
22
16
1.86
124766845--124766892
24
2.0
25
84
8
64
58
4
6
31
1.42
124774859--124774888
14
2.1
14
100
0
60
13
16
0
70
1.18
124780399--124780452
27
2.0
27
89
7
83
62
1
0
35
1.06
124780416--124780465
20
2.8
17
81
18
66
64
0
0
36
0.94
124780415--124780480
17
3.8
17
77
16
64
63
0
1
34
1.04
124780398--124780507
25
4.5
25
75
14
95
64
0
0
33
1.06
124780490--124780563
10
7.8
10
68
17
50
63
4
1
31
1.21
124780491--124780563
28
2.7
24
82
18
56
64
4
1
30
1.20
124780999--124781198
9
21.7
9
69
19
94
32
2
2
63
1.19
124782337--124782369
2
17.0
2
93
6
59
0
48
0
51
1.00
124786625--124786687
33
1.9
33
96
3
119
60
6
4
28
1.42
124793813--124793867
18
3.1
17
84
10
58
47
1
1
49
1.23
124796890--124796919
2
15.5
2
93
6
53
0
46
0
53
1.00
124802260--124802330
35
2.0
35
100
0
142
29
16
5
47
1.70
124803880--124803966
43
2.0
43
100
0
174
44
20
4
29
1.71
124804706--124804774
36
1.9
36
100
0
138
49
8
10
31
1.67
124805091--124805131
3
13.7
3
100
0
82
31
0
0
68
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
124805240--124805279
20
2.1
19
86
9
55
60
2
5
32
1.32
124805351--124805400
22
2.3
22
83
13
59
50
0
8
42
1.32
124808631--124808664
16
2.1
17
88
5
52
5
32
35
26
1.81
124809568--124809671
53
2.0
52
84
5
138
34
25
13
26
1.93
124817086--124817221
52
2.6
52
81
8
168
31
25
14
27
1.95
124825683--124825750
34
2.0
34
100
0
136
41
11
17
29
1.85
124825936--124826029
19
5.2
18
71
13
77
42
13
3
40
1.61
124825936--124826045
54
2.0
54
98
0
211
43
12
2
40
1.57
124828353--124828433
42
1.9
42
94
0
144
46
14
7
30
1.72
124828462--124828505
19
2.4
18
88
7
70
43
13
2
40
1.57
124839142--124839249
54
2.0
54
90
3
173
18
52
12
16
1.74
124853365--124853403
14
2.8
14
88
7
53
41
7
17
33
1.79
124853997--124854052
22
2.6
22
83
5
62
51
0
0
48
1.00
124854440--124854504
29
2.2
28
76
12
69
47
6
4
41
1.49
124854854--124854887
2
17.5
2
93
6
61
47
0
0
52
1.00
124855716--124855761
23
2.0
24
91
4
76
28
0
19
52
1.47
124856658--124856696
16
2.4
17
83
12
55
51
0
0
48
1.00
124857005--124857047
21
2.0
21
82
8
52
48
0
2
48
1.14
124857033--124857087
22
2.5
22
85
5
67
54
3
5
36
1.41
124857283--124857311
12
2.3
13
94
5
51
0
27
3
68
1.05
124871156--124871182
6
4.5
6
100
0
54
14
85
0
0
0.61
124872224--124872251
14
2.0
14
100
0
56
21
14
35
28
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
124874189--124874358
51
3.2
53
79
12
186
41
12
17
28
1.86
124884547--124884601
28
2.0
28
96
0
101
38
18
14
29
1.90
124886533--124886590
25
2.4
23
77
8
62
48
5
1
44
1.35
124889327--124889355
2
15.0
2
92
7
51
48
0
0
51
1.00
124911504--124911561
29
2.0
29
100
0
116
17
20
17
44
1.86
124912615--124912646
15
2.1
15
100
0
64
46
0
15
37
1.46
124919785--124919871
44
2.0
44
100
0
174
33
16
16
34
1.91
124931658--124931931
138
2.0
138
91
0
440
28
17
20
33
1.96
124936761--124936787
12
2.2
12
100
0
54
18
14
33
33
1.92
124937297--124937355
20
3.0
20
82
0
82
18
33
33
13
1.90
124940370--124940423
27
2.0
28
85
10
76
51
7
3
37
1.48
124940932--124940988
29
1.9
30
85
3
80
61
0
1
36
1.07
124941177--124941264
23
3.8
23
81
4
79
30
9
18
42
1.81
124950537--124950565
5
5.8
5
100
0
58
41
0
20
37
1.53
124954640--124954670
2
15.5
2
93
0
53
48
3
0
48
1.17
124963287--124963318
5
6.6
5
92
7
57
62
0
0
37
0.95
124965481--124965583
31
3.4
31
73
23
87
30
4
2
62
1.31
124965460--124965612
61
2.5
62
73
15
151
28
5
2
64
1.29
124965551--124965602
20
2.7
20
81
3
61
30
1
3
63
1.23
124965480--124965611
30
4.4
31
74
13
98
29
4
3
62
1.30
124965550--124965603
19
2.8
18
75
10
54
29
1
3
64
1.21
124972979--124973027
21
2.2
23
82
7
57
6
34
2
57
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
124997919--124997958
2
20.0
2
94
0
71
52
0
0
47
1.00
125002381--125002415
2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
125004684--125004794
47
2.4
47
77
8
127
36
21
15
27
1.93
125006119--125006156
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
125014961--125014990
13
2.3
13
100
0
60
26
10
23
40
1.86
125022495--125022553
29
2.0
29
96
0
109
22
13
27
37
1.91
125023654--125023695
19
2.2
19
83
8
50
9
9
2
78
1.05
125023653--125023706
13
4.3
12
77
9
54
11
11
1
75
1.11
125031397--125031450
23
2.3
23
84
6
65
37
3
12
46
1.60
125038354--125038384
16
2.0
16
93
6
55
0
19
0
80
0.71

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444