Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  114  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28936605--28936704
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2.0
50
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1
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2.0
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0
0
60
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22
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1.8
93
96
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20
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20
1.98
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222
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30
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27
25
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32
1.95
28976407--28976538
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2.3
58
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185
27
26
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1.9
18
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12
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3.8
46
79
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201
21
20
29
28
1.98
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170
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17
20
28
1.96
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31
17
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1.96
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2.1
226
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1
617
32
18
19
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1.96
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2.0
15
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16
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3.5
126
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2
676
37
15
19
27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
20
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5
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17
20
22
40
1.92
29043398--29043575
43
4.2
42
83
5
207
27
31
19
21
1.97
29043397--29043575
85
2.1
86
81
7
213
27
31
18
21
1.97
29048584--29048743
29
5.5
29
82
4
180
26
16
31
25
1.97
29051414--29051464
14
3.8
13
73
17
50
43
37
0
19
1.51
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21
1.9
21
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57
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4.1
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25
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23
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18
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29052304--29052344
14
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10
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48
31
0
19
1.49
29052302--29052345
21
2.1
21
86
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61
45
36
0
18
1.49
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40
2.6
40
86
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138
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23
19
30
1.98
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8
359
26
21
20
31
1.98
29052692--29052750
30
2.0
30
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0
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18
16
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1.89
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2.2
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1.42
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117
2.1
117
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55
4
4
35
1.42
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2.4
18
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27
18
1.80
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1.9
30
88
0
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17
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7
5.7
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0
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52
15
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29055526--29055566
21
2.0
21
95
0
73
51
14
0
34
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29056708--29056747
21
1.9
21
90
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22
25
1.78
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21
2.2
22
85
7
62
44
6
21
27
1.76
29056744--29056783
22
1.9
20
85
10
53
40
2
27
30
1.70
29056738--29056789
22
2.5
20
76
17
52
40
1
28
28
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16
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5
50
76
14
0
8
1.01
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27
18
28
1.98
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2.2
94
84
7
259
25
26
19
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1.98
29080136--29080308
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3.7
44
76
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152
24
26
20
27
1.99
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0
100
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0
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0.95
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22
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0
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37
0
0
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37
0
0
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24
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20
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20
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20
94
0
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31
20
1.95
29139894--29139970
40
1.9
40
97
0
145
18
32
29
19
1.95
29139996--29140027
13
2.5
13
89
0
55
18
37
34
9
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.0
52
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12
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30
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16
26
1.96
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2.0
47
100
0
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29
1.87
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0
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36
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346
2.0
347
96
0
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14
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1.87
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96
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1
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16
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27
1.94
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14
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14
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0
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29
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3
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1.71
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58
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1
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1.96
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2.5
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28
1.97
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2.3
144
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2
431
25
16
30
28
1.97
29193241--29193551
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1.97
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3.5
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26
0
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0
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0
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2.0
68
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2
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0
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0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
19
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2
5
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2.5
23
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2.0
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0
0
39
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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0
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0
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0
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0
0
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0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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