Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  400  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116307095--116307134
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1.9
21
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10
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17
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4.2
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2.5
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3
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4.2
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7.4
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18
0
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0
48
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1.48
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4.2
26
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0
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2.5
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3
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39
39
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13
1.74
116338906--116338956
20
2.6
20
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3
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33
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1.74
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20
2.5
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0
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0
0
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40
4.7
40
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26
26
20
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84
3.8
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0
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3.2
125
82
3
445
41
20
16
21
1.90
116348922--116349324
42
9.6
42
80
4
404
41
20
16
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1.90
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2.0
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32
14
0
52
1.42
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2.0
85
98
1
333
45
12
14
28
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116351749--116351793
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2.1
21
100
0
90
28
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31
22
1.97
116354896--116354928
15
2.2
15
89
10
50
54
3
0
42
1.15
116354870--116355096
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1.8
124
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293
59
4
3
32
1.37
116355171--116355240
3
22.0
3
88
8
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62
4
0
32
1.14
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3
25.3
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73
19
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1
3
30
1.20
116355315--116355392
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6.3
12
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72
64
1
3
30
1.20
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2.9
30
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3
30
1.15
116355315--116355403
26
3.5
27
72
17
82
66
1
3
29
1.15
116355320--116355404
9
8.8
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1
3
28
1.15
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4.4
68
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0
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24
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10.8
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87
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20
36
1.96
116356718--116357657
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3.6
262
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1294
20
22
20
36
1.96
116356718--116357666
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2.7
344
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1345
20
22
20
36
1.96
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9.0
132
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1930
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1.96
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57
5
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3
29
1.16
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30
1.16
116366091--116366150
18
3.2
18
82
13
75
63
1
3
31
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
24
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20.5
2
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0
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0
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16
33
1.92
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3.5
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140
20
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27
1.99
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1.9
80
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183
22
30
24
22
1.99
116377296--116377403
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2.7
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128
21
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25
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20
86
3
62
72
2
2
22
1.05
116391712--116391745
13
2.6
13
86
13
52
11
2
5
79
1.02
116391712--116391747
14
2.6
14
91
4
56
13
2
5
77
1.05
116392215--116392314
35
2.8
35
93
1
173
13
0
41
46
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
48
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2
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34
19
10
35
1.87
116397926--116397958
13
2.3
15
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15
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3
18
0
78
0.87
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27
2.0
27
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1
5
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1.32
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29
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2
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0
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0
0
50
1.00
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1.9
49
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0
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21
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1.81
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30
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30
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25
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1.94
116411507--116411638
58
2.3
58
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4
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28
26
13
31
1.94
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30
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29
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28
26
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1.94
116419451--116419579
58
2.3
58
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5
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28
27
13
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1.94
116423277--116423604
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28
29
1.87
116423277--116423617
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93
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580
33
8
28
29
1.86
116423278--116423617
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2.4
139
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33
8
28
29
1.86
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0
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1.81
116423787--116423913
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37
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0
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1.97
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39
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25
20
27
27
1.99
116425819--116426155
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79
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300
25
20
27
27
1.99
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1.88
116429280--116429711
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27
28
1.88
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48
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0
286
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1.97
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6.2
38
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3
273
30
23
21
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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3.3
37
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0
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1.97
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49
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1
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28
1.88
116440273--116440486
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2.2
98
97
1
412
29
32
9
28
1.88
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25
25
2.00
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0
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1.96
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21
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1.99
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1.98
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1.98
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20
1.98
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0
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29
21
20
1.98
116501993--116502168
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28
29
21
20
1.98
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27
9.3
27
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28
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1.84
116504790--116505040
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3.1
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28
22
8
40
1.84
116504990--116505128
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27
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38
23
6
31
1.80
116504790--116505039
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0
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1.84
116505033--116505186
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200
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1.80
116505026--116505186
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2.0
81
86
0
223
39
20
7
32
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
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25
1.99
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0
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0
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1.98
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0
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28
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29
1.95
116536674--116536745
29
2.5
28
91
6
110
29
13
27
29
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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