Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  258  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73633845--73633997
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79
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0
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1.9
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0
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1.9
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20
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17
16
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2
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18
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4.2
26
95
0
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25
2.0
26
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70
25
13
23
38
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4.2
23
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16
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36
26
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30
1.81
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43
1.9
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149
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28
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29
1.83
73669782--73669932
25
6.2
24
84
12
177
36
23
5
35
1.77
73669782--73669932
75
2.1
70
90
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232
36
23
5
35
1.77
73669782--73669932
50
3.1
50
89
8
217
36
23
5
35
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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7
35
1.82
73674202--73674312
48
2.4
48
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6
31
1.50
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24
3.4
24
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30
1.52
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2.8
20
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5
1
37
1.34
73674293--73674372
20
4.1
20
79
4
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2
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18
123
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3
1
37
1.27
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18
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70
58
1
1
37
1.20
73674405--73674448
19
2.4
18
88
3
61
59
2
2
36
1.23
73677123--73677148
3
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0
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0
0
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0
0
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1
25
1.03
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2
20
1.06
73681090--73681186
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1
30
1.05
73681137--73681200
17
4.1
16
76
15
62
71
1
1
25
1.03
73681482--73681535
14
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38
1
0
59
1.08
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13
0
0
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56
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0
0
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21
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0
55
26
2
0
70
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73682235--73682261
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13
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0
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39
0
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1.44
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5.0
10
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22
6
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1.20
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20
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0
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16
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48
0
12
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1.42
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21
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54
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1.41
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602
26
27
15
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1.96
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3.6
131
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1.96
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26
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2.1
52
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3
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37
23
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32
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
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29
14
33
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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