Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  234  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66201103--66201136
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2.1
16
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50
52
0
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24
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1.95
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164
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15
26
26
1.96
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101
2.1
101
92
0
352
33
15
24
27
1.95
66209460--66209705
101
2.5
101
86
4
329
32
15
25
26
1.96
66211086--66211129
23
1.9
23
85
0
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43
4
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38
1.65
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1.42
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2.00
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4.6
39
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138
26
23
27
22
2.00
66235064--66235252
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4
186
23
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1.9
30
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35
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2.1
29
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102
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20
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1.41
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3.7
19
71
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1.21
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19
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20
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5
0
30
1.17
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0
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77
27
0
4
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1.11
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1.9
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95
0
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16
1.95
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48
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5.0
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1
546
26
27
16
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1.97
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192
2.5
192
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1
606
26
27
16
29
1.97
66270271--66270326
25
2.2
25
83
0
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35
17
25
21
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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15
62
67
0
26
6
1.15
66271414--66271457
22
2.0
22
82
8
54
34
6
22
36
1.81
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26
2.7
26
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2
84
17
20
23
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66273726--66273821
49
2.0
49
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16
19
22
40
1.91
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25
2.0
25
87
0
71
22
26
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32
1.97
66277403--66277462
26
2.4
24
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1
0
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21
2.7
21
83
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62
69
5
0
25
1.09
66278151--66278186
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15
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19
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16
2.1
16
88
0
50
58
0
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29
1.33
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29
2.5
28
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2
0
48
1.16
66281721--66281774
29
2.0
29
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0
0
51
1.00
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0
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25
26
19
28
1.98
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48
2.4
48
89
0
174
24
24
20
30
1.98
66292890--66292928
20
2.0
20
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10
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35
20
0
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1.52
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2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
66300669--66300880
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4.6
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9
188
23
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19
26
1.98
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50
3.7
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12
160
28
26
17
27
1.98
66309017--66309238
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5.7
38
84
8
225
25
22
27
25
2.00
66315298--66315514
40
5.5
39
87
5
251
25
21
27
25
1.99
66315298--66315512
78
2.7
80
85
7
276
26
21
26
25
1.99
66315344--66315546
78
2.6
78
83
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216
26
21
27
24
1.99
66319360--66319461
47
2.2
47
84
10
145
29
22
19
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66322735--66322911
57
3.1
58
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2
178
29
19
5
45
1.73
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2.0
37
89
0
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36
9
14
40
1.78
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19
5.1
19
72
12
77
29
9
13
47
1.75
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54
2.4
54
92
0
213
32
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14
43
1.78
66327651--66327724
18
4.3
17
77
14
71
35
22
1
40
1.63
66327651--66327724
17
4.3
17
81
8
78
35
22
1
40
1.63
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5
5.6
5
100
0
56
0
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0
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2.1
17
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2
17
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1.14
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1
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1.20
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11
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1
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2
0
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1.07
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15
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63
2
0
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1.08
66329293--66329379
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79
10
96
63
2
0
34
1.07
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20
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26
2.0
26
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7
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20
15
26
1.92
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30
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0
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1.80
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44
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7
122
33
28
13
25
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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0
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29
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1.66
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2
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10
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19
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19
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7
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2
20
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1.96
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102
27
28
14
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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148
22
26
23
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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24
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1.98
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101
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1.98
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1.98
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27
27
19
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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