Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  181  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
50565816--50566005
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30
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170
31
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29
22
1.96
50583697--50583880
67
2.8
64
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203
28
16
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1.9
33
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19
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0
0
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23
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25
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3.8
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24
24
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23
27
24
2.00
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24
2.00
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3.8
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193
24
24
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23
2.00
50618135--50618326
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4.8
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178
23
23
27
24
2.00
50618135--50618353
80
2.7
79
77
8
212
25
23
26
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
50624574--50624702
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43
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3
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19
19
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21
2.2
20
84
12
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59
2
29
9
1.41
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0
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1.35
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22
2.0
23
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40
0
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38
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15
100
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6
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0
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2.0
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29
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3.5
40
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23
26
21
1.99
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23
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25
2.00
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3.5
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124
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23
26
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1.99
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40
2.7
39
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24
27
23
2.00
50661620--50661748
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3.2
40
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3
154
24
23
27
25
2.00
50664788--50664944
23
6.8
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72
17
80
35
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21
23
1.96
50664853--50664919
24
2.8
24
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75
37
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20
1.95
50670244--50670322
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2.5
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0
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27
32
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3.8
48
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4
202
24
28
19
27
1.98
50672035--50672303
48
5.6
47
73
15
169
24
27
19
28
1.98
50672083--50672303
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2.3
95
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236
24
28
18
28
1.98
50677409--50677434
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2.0
13
100
0
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7
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28
1.98
50688635--50688758
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2.7
46
78
12
112
25
28
19
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
50690936--50690970
17
2.0
18
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17
1.58
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2.1
30
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29
1.91
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3.9
38
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24
21
30
24
1.99
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3.7
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20
29
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1.99
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2.3
79
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1
278
24
22
29
23
1.99
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19
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56
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1.92
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2.9
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1
310
24
21
31
22
1.98
50801240--50801309
27
2.6
27
93
2
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28
14
27
1.95
50807102--50807265
40
4.1
40
81
6
179
25
21
28
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
50815747--50815816
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2.6
27
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2
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30
27
14
28
1.95
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1.9
299
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2
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18
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1.96
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2.5
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0
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1.96
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7
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0
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24
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28
22
21
27
1.99
50828029--50828169
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6.0
23
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203
28
22
21
26
1.99
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1.84
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20
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2.00
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1.97
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1.96
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1.96
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2.7
48
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2
179
28
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24
1.97
50877213--50877324
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25
1.99
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3.5
39
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5
156
23
29
23
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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40
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23
24
1.99
50880705--50880895
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1.99
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1.98
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1.98
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1.8
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0
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1.98
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1.98
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3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
50907398--50907477
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1.98
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1.98
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2.00
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1.99
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1.97
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28
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83
31
17
25
24
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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