Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  428  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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78
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4.2
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3
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23
36
1.94
123733189--123733303
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2.1
54
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3
169
16
23
23
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4.2
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0
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5
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123743018--123743127
26
4.2
26
97
0
184
33
5
24
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1.79
123744606--123744657
25
2.0
26
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3
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123760930--123761043
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1.9
19
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2.1
24
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2.0
25
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
A
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(0-2)
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123868862--123868905
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2.6
16
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10
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84
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0
13
0.73
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2.0
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0
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1.82
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2.4
33
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0
120
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7
26
1.82
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2.2
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68
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2.9
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28
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47
73
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178
23
26
19
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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56
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2.4
20
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3
0
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29
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1
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2.8
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1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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2
1
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1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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10
58
42
5
17
33
1.73

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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