Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  52  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12531641--12531816
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3.8
46
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20
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28
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1.8
93
93
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20
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1.99
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157
31
27
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1.96
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26
2.0
26
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1
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2.0
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0
0
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0
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2
377
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18
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5
528
31
22
17
29
1.96
12557965--12558288
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4.5
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86
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29
22
17
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1.9
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22
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0
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31
22
17
28
1.96
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3.9
71
70
14
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1.96
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2.1
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1.60
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2.0
27
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2.1
28
87
3
84
28
6
13
51
1.66
12592195--12592247
26
2.0
26
88
0
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58
5
20
15
1.57
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0
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0
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1.8
123
92
1
374
46
9
10
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2.1
16
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51
0
0
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19
2.1
20
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4
57
21
2
29
46
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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0
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23
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19
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2
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2
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0
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51
0
0
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1.00
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0
0
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45
2.2
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177
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5
8
57
1.53
12613272--12613327
27
2.1
27
96
0
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30
1.79
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1.9
17
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30
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12619224--12619336
27
3.9
28
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21
99
24
25
21
28
1.99
12619236--12619372
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86
8
179
24
24
21
29
1.99
12619365--12619410
20
2.3
20
82
14
60
28
28
17
26
1.98
12619377--12619420
19
2.2
20
84
4
54
34
25
18
22
1.96
12622125--12622182
29
2.0
29
96
0
107
27
8
10
53
1.64
12623180--12623292
27
3.9
27
68
21
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26
24
19
29
1.98
12623192--12623328
60
2.3
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81
8
152
26
24
18
30
1.98
12626168--12626192
7
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7
100
0
50
88
0
12
0
0.53
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14
100
0
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51
6
16
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5
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0
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12
20
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12
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20
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2
41
1.31
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2.7
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15
108
50
3
2
42
1.35
12648887--12648982
50
2.0
48
91
4
156
53
3
3
40
1.33
12655672--12655703
15
2.1
15
100
0
64
37
9
18
34
1.83
12660101--12660196
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2.1
45
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113
26
13
16
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1.85
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30
2.1
30
81
12
72
41
0
0
58
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12667723--12667789
23
2.9
23
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0
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13
20
1.79
12669986--12670166
46
3.9
46
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9
224
21
21
29
27
1.99
12669988--12670158
93
1.8
93
94
0
306
21
22
29
27
1.99
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18
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15
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15
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73
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21
1
1.10
12674701--12674752
14
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13
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14
52
55
0
3
40
1.18
12674713--12674751
12
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14
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18
55
58
0
5
35
1.20
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2.8
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5
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1.40
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2.0
20
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0
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48
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41
88
1
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24
24
19
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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1
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2
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28
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3
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24
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19
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2
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20
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12719705--12719891
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12729493--12729552
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18
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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33
3
3
58
1.32

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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