Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  25  of  444  ( 53255 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6494736--6494844
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0
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0
2
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2.1
23
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3
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2.3
20
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14
60
65
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26
1.21
6506031--6506075
19
2.3
20
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0
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0
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1.9
41
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0
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10
6
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1.49
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3
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18
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1
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30
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14
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14
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10
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60
1
3
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6512174--6512237
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2.3
28
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1
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21
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9
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0
9
21
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2.9
22
90
0
90
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4
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1.51
6514375--6514525
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69
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211
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1.91
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43
19
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23
1.93
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12
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34
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15
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3
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3
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18
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1
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30
1.33
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14
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10
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1
3
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6527522--6527585
26
2.3
28
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7
78
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1
3
32
1.20
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22
2.9
22
92
0
99
7
6
53
31
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6529347--6529386
2
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2
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10
57
50
0
2
47
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21
2.3
21
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12
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42
0
2
56
1.11
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19
2.4
20
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17
53
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6
2
23
1.25
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11
3.3
11
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28
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42
20
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5
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118
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34
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2.1
24
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10
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0
4
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18
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0
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19
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1.93
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11
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51
34
4
42
19
1.70
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1.9
16
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0
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1.62
6551692--6551738
24
1.9
25
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60
34
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44
1.71
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2.1
136
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4.2
26
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2
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4
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1.75
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21
3.4
22
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17
75
62
0
2
35
1.10
6557760--6557813
24
2.3
24
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3
74
62
0
3
33
1.12
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2.2
24
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6
63
64
0
3
32
1.12
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26
4.2
26
92
0
180
32
6
24
37
1.81
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26
2.0
26
82
7
63
39
20
15
24
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6565412--6565454
11
3.7
11
79
11
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46
13
2
37
1.57
6565407--6565459
24
2.2
25
93
3
90
49
11
1
37
1.50
6565687--6565744
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19
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14
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0
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2.0
40
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0
108
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2
9
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1.38
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28
2.5
28
95
0
120
15
53
13
17
1.73
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25
2.6
23
73
24
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28
6
3
61
1.36
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2
87.0
2
72
14
91
42
3
3
50
1.35
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2.0
35
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1.44
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25
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1.52
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14
4.1
14
75
11
62
28
10
5
55
1.56
6569571--6569609
20
2.0
20
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0
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23
5
2
69
1.21
6569572--6569649
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3.4
23
84
10
90
24
6
1
67
1.21
6569572--6569670
3
35.7
3
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11
52
27
7
1
64
1.26
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19
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18
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29
0
2
68
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15
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0
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0
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23
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12
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58
4
6
30
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6588056--6588129
29
2.6
29
86
0
103
22
37
22
16
1.93
6592162--6592202
20
2.1
19
86
4
55
56
7
0
36
1.27
6592199--6592295
28
3.5
27
70
12
79
59
4
2
34
1.28
6595325--6595384
30
2.0
30
96
3
113
16
10
6
66
1.41
6599132--6599293
71
2.3
71
100
0
324
34
16
29
19
1.94
6603687--6603717
16
1.9
16
93
0
53
29
16
12
41
1.85
6607777--6607819
23
2.0
21
81
9
50
23
9
6
60
1.51
6612842--6612903
30
2.1
30
90
0
97
50
3
0
46
1.17
6613670--6613720
19
2.6
20
78
6
59
54
5
0
39
1.24
6614002--6614049
24
2.0
25
83
4
62
33
16
6
43
1.73
6622346--6622401
28
2.0
28
96
0
103
46
16
10
26
1.79
6627311--6627369
29
2.0
29
100
0
118
23
13
28
33
1.93
6632907--6633022
58
2.0
58
98
0
223
35
13
18
32
1.90
6634754--6634786
17
2.0
17
88
5
50
33
15
3
48
1.60
6635067--6635390
46
7.0
46
90
0
434
20
24
14
41
1.89
6637084--6637127
13
3.8
12
82
17
58
11
29
0
59
1.32
6637083--6637127
21
2.0
24
87
12
69
11
31
0
57
1.33
6638735--6638832
19
5.4
18
68
17
60
59
3
2
35
1.25
6638774--6638839
9
6.9
9
76
10
51
59
3
3
34
1.28
6640186--6640249
32
2.0
32
87
0
92
48
7
0
43
1.32
6642722--6642781
23
2.6
24
75
15
63
65
1
0
33
1.03
6644275--6644350
17
4.5
16
78
18
75
34
31
19
14
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6644373--6644400
8
3.5
8
100
0
56
21
35
14
28
1.92
6650189--6650239
25
2.0
25
100
0
102
27
7
19
45
1.78
6652755--6652884
43
3.0
43
78
7
140
30
26
15
27
1.96
6658103--6658141
19
2.0
19
85
5
51
56
5
0
38
1.22
6662148--6662231
41
2.0
43
81
11
102
23
1
9
65
1.29
6662424--6662498
30
2.5
30
95
2
132
40
2
9
48
1.50
6666307--6666355
26
2.0
24
88
8
71
63
6
0
30
1.19
6666446--6666487
23
2.0
22
86
13
61
64
0
4
30
1.14
6667780--6667861
41
2.0
41
95
0
146
23
13
28
35
1.92
6668415--6668448
17
2.1
17
88
5
52
73
0
0
26
0.83
6668934--6668966
17
1.9
18
88
11
52
48
0
9
42
1.35
6671718--6671758
20
2.0
21
86
13
59
58
4
2
34
1.32
6672319--6672349
11
2.8
11
90
0
53
32
0
0
67
0.91
6675391--6675428
3
12.7
3
94
0
67
65
0
2
31
1.06
6675492--6675526
18
1.9
18
88
0
52
54
5
0
40
1.24
6675489--6675528
20
2.0
20
85
0
53
55
5
0
40
1.22
6675640--6675697
25
2.3
26
86
13
79
56
8
3
31
1.46
6675638--6675704
26
2.6
25
79
13
73
56
7
4
31
1.47
6675891--6675929
15
2.5
16
87
8
62
69
0
0
30
0.89
6675896--6675966
32
2.4
30
75
13
74
67
1
1
29
1.07
6676611--6676702
43
2.2
43
77
12
100
61
3
4
30
1.31
6677257--6677294
18
2.1
18
100
0
76
68
0
31
0
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6677446--6677496
10
5.4
9
77
13
50
84
0
9
5
0.78
6677446--6677532
29
3.0
27
73
16
77
78
1
12
8
1.02
6677446--6677501
19
3.0
19
78
19
64
82
0
10
7
0.85
6684264--6684374
40
2.8
39
85
9
136
22
28
26
22
1.99
6691696--6691891
40
4.8
41
94
1
342
27
21
29
21
1.99
6691696--6691892
81
2.4
81
94
2
342
27
21
28
21
1.99
6691930--6692000
37
1.9
37
85
0
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0
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1.52
6692114--6692177
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9.0
7
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23
3
26
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1.67
6692130--6692180
15
3.5
15
81
2
59
21
1
29
47
1.62
6692769--6692793
7
3.6
7
100
0
50
64
0
0
36
0.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444