Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  444  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
129162922--129162972
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18
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0.00
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2.1
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2.1
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2.0
21
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21
29
19
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129208424--129208700
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2.0
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100
0
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34
1.85
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2.0
26
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38
20
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2
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129224961--129224999
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17
0
23
58
1.38
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2.9
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2.0
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5
40
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3.7
17
70
21
51
44
1
3
50
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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24
1.55
129281966--129282019
12
4.5
12
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0
81
42
0
33
24
1.55
129281970--129282016
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6
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21
1.52
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10
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10
100
0
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46
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2.3
21
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1.20
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33
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13
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36
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17
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7
7
78
1.09
129342080--129342151
22
3.1
22
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11
81
45
0
1
52
1.09
129342102--129342230
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0
1
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71
41
1
2
54
1.23
129342106--129342345
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2.6
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13
221
43
1
2
52
1.24
129342295--129342340
20
2.2
22
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0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
1.03
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1.9
19
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1.33
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29
1.94
129397650--129397792
50
2.9
50
91
0
214
27
28
13
30
1.94
129397652--129397792
75
1.9
75
88
5
214
28
29
13
29
1.94
129408307--129408429
39
3.2
39
92
0
210
39
24
25
11
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
129417906--129417946
17
2.4
17
84
15
50
26
9
4
58
1.50
129418199--129418261
31
2.0
31
100
0
126
19
17
12
50
1.77
129425183--129425237
25
2.2
25
90
3
85
40
9
20
30
1.83
129432960--129433131
47
3.6
48
82
5
190
33
27
14
23
1.94
129438682--129438814
47
2.8
47
95
0
230
39
22
13
24
1.90
129444651--129444783
47
2.8
47
96
0
239
39
21
13
25
1.90
129448119--129448170
12
3.9
13
78
16
54
61
5
0
32
1.20
129448248--129448330
3
27.3
3
73
20
59
65
1
3
30
1.17
129448248--129448331
12
6.8
12
77
16
75
65
1
3
29
1.17
129448253--129448312
18
3.2
18
82
13
75
63
1
3
31
1.20
129448725--129448815
22
4.0
22
81
16
103
12
0
51
36
1.39
129448797--129448824
9
3.1
9
100
0
56
10
0
53
35
1.36
129448735--129448806
13
5.8
13
81
15
82
11
0
50
38
1.38
129451767--129451874
44
2.4
44
85
3
135
28
23
14
33
1.94
129454047--129454180
54
2.5
53
82
3
153
26
24
17
32
1.97
129457338--129457474
53
2.6
52
84
3
168
24
15
28
31
1.95
129460617--129460674
28
2.1
28
96
0
107
46
27
8
17
1.77
129460677--129460732
23
2.6
22
81
10
62
42
37
7
12
1.70
129460936--129460970
5
6.8
5
87
6
52
77
0
17
5
0.96
129462964--129463009
21
2.2
21
84
0
56
71
8
13
6
1.29
129464732--129464954
118
1.9
115
87
4
324
45
14
12
27
1.81
129469854--129469901
19
2.6
19
80
9
55
35
2
14
47
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
129469911--129470007
43
2.3
43
91
5
153
28
6
15
49
1.68
129474584--129474631
19
2.6
19
80
9
55
35
2
14
47
1.56
129474645--129474737
43
2.2
43
92
3
152
27
6
13
51
1.66
129475736--129475770
2
17.5
2
100
0
70
48
0
51
0
1.00
129482210--129482259
21
2.4
22
80
10
59
62
4
0
34
1.14
129482300--129482357
30
1.9
30
92
0
98
58
10
0
31
1.31
129482389--129482472
11
7.8
11
74
4
73
70
2
3
23
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444

The End!