Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr10 129486693 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  35  of  444  ( 53255 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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6
33
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
8739372--8739525
9
16.3
9
65
19
57
65
1
3
28
1.21
8739458--8739505
17
2.8
17
87
3
69
70
0
4
25
1.04
8739448--8739506
27
2.2
26
80
14
68
72
1
3
22
1.08
8739450--8739505
8
6.6
8
75
18
51
71
1
3
23
1.11
8739434--8739525
10
9.8
9
70
22
57
65
2
3
29
1.20
8739535--8739566
7
4.4
7
96
4
55
43
0
0
56
0.99
8739870--8739936
27
2.3
29
85
10
84
28
1
2
67
1.14
8739862--8739937
30
2.6
29
78
18
77
27
2
3
65
1.23
8740651--8740676
13
2.0
13
100
0
52
15
30
38
15
1.88
8749200--8749260
30
2.1
29
90
3
95
24
14
21
39
1.91
8751925--8752184
20
13.5
19
65
20
80
40
13
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38
1.75
8752301--8752392
20
4.6
20
78
10
107
35
11
13
39
1.81
8752301--8752392
40
2.3
40
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118
35
11
13
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1.81
8752343--8752405
20
3.2
19
78
10
65
36
12
14
36
1.84
8752318--8752420
40
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40
80
10
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9
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13
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13
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45
0
0
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8753517--8753551
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0
60
0.97
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0
0
48
1.00
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16
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16
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0
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1.45
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2
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0
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0
3
50
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28
1.9
27
88
3
79
26
9
9
54
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8787858--8787892
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1.9
19
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11
2
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1.37
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14
2.2
14
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0
53
32
9
19
38
1.84
8792928--8792963
18
2.1
18
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56
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36
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27
1.90
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6
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6
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4
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0
60
0
0.97
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0
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0
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0
2
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9
5.2
9
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2
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0
2
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1.13
8796622--8796668
13
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13
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2
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1.13
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15
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0
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0
0
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2.7
29
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0
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1.22
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17
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26
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1.27
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16
2.3
17
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2
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1.17
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23
2.2
24
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3
68
37
1
3
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1.29
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2.0
26
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1
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1.30
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23
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1.62
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1.06
8818035--8818089
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3
20
1.06
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25
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14
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0
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8820210--8820250
18
2.2
19
87
12
59
29
24
0
46
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8820647--8820687
10
4.3
10
81
12
50
31
24
0
43
1.54
8823305--8823353
26
2.0
24
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11
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63
6
0
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1.19
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4.1
21
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18
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69
6
0
23
1.12
8824196--8824522
132
2.5
132
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19
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0
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12
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0
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20
85
11
65
62
3
1
32
1.24

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444