Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  345  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99953626--99953663
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18
1.82
99961634--99961671
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
99963295--99963363
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
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2.0
26
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0
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3
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2.0
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20
88
0
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2
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1.50
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1.82
99975179--99975216
20
1.9
20
88
0
58
34
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10
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1.50
99976841--99976909
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
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2.0
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0
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42
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99981314--99981361
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2.3
21
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78
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0
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1.51
99981322--99981371
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2.3
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91
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428
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3.0
123
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14
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1.51
99985335--99985397
9
7.0
9
81
0
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47
14
1
36
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
20
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16
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16
38
1.90
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2.0
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16
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100
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24
15
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2.0
61
100
0
250
28
19
8
44
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100023628--100023668
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2.3
18
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14
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2.5
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24
23
2.00
100066754--100066921
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100122131--100122168
13
2.9
13
88
7
51
39
34
0
26
1.57
100123027--100123213
93
2.0
93
98
0
365
25
19
9
46
1.79
100125076--100125118
17
2.6
17
81
3
52
41
20
4
32
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100129850--100129889
19
2.0
20
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4
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2
12
7
1.07
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1.9
18
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5
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35
5
5
52
1.50
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2.1
21
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8
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16
4
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19
1.9
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8
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1.61
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22
2.3
24
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15
78
23
18
7
50
1.71
100145396--100145442
22
2.1
22
96
0
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25
19
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21
2.0
22
85
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2
2
26
1.13
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2.7
29
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0
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21
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29
2.7
29
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0
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26
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6
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0
1
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29
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1.95
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0
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2
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20
1.98
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27
30
21
21
1.98
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2.0
29
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0
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1.97
100199716--100199949
48
4.9
48
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245
23
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1.97
100201966--100202014
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2.1
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2.1
27
100
0
112
51
7
7
33
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100205508--100205545
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20
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23
0
36
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21
23
1.99
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1.8
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1
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21
22
1.99
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24
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24
2.00
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2.0
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28
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1.99
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1
100
0
50
100
0
0
0
0.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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56
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30
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2
0
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1.05
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0
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5.8
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70
12
176
26
18
29
24
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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