Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  331  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95549102--95549133
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0
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0
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28
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2.6
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1
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0
37
1.23
95554234--95554349
39
3.1
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2.0
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7
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83
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6
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18
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16
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17
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28
3.5
28
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5
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30
15
28
27
1.96
95589773--95589848
29
2.7
28
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13
75
30
14
26
28
1.95
95595591--95595767
40
4.4
39
76
7
151
24
24
23
27
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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24
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26
2.00
95596476--95596511
2
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2
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0
0
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1.00
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80
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22
1.99
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21
29
25
23
1.99
95610396--95610544
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
95610437--95610544
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
95613831--95614011
40
4.5
40
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4
204
26
23
27
22
1.99
95613831--95614029
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2.5
80
80
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229
25
21
28
24
1.99
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20
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33
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20
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1.51
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147
20
19
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26
1.97
95633154--95633208
23
2.5
23
80
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1
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2
0
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0
0
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51
17
0
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79
0.87
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22
2.2
22
92
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20
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13
8
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56
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2.4
25
77
5
66
40
0
5
55
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95655433--95655493
22
2.8
22
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97
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6
1
45
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95655433--95655503
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3.2
22
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83
46
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1
45
1.39
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26
4.2
26
92
0
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33
1.80
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23
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37
25
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1.92
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0
0
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28
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3
109
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29
15
27
1.96
95755710--95755779
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.6
27
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2
122
30
27
14
28
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4.9
54
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1
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1.79
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2
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1.79
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27
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18
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1.94
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2.00
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2.00
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1.99
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1.98
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1.98
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1.99
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1.99
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95804592--95804708
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12
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48
38
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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4
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40
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.21
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82
7
212
24
21
28
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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